Studi asosiasi genome-wide (GWAS) bertujuan untuk mengidentifikasi varian genetik (genotipe) yang berhubungan dengan sifat-sifat tertentu (fenotipe).Studi GWA menyelidiki penanda genetik melintasi seluruh genom sejumlah besar individu dan memprediksi hubungan genotipe-fenotip melalui analisis statistik pada tingkat populasi.Pengurutan ulang seluruh genom berpotensi menemukan semua varian genetik.Ditambah dengan data fenotipik, GWAS dapat diproses untuk mengidentifikasi SNP, QTL, dan gen kandidat terkait fenotip, yang sangat mendukung pemuliaan hewan/tanaman modern.SLAF adalah strategi pengurutan genom sederhana yang dikembangkan sendiri, yang menemukan penanda terdistribusi di seluruh genom, SNP.SNP ini, sebagai penanda genetik molekuler, dapat diproses untuk studi asosiasi dengan sifat-sifat yang ditargetkan.Ini adalah strategi hemat biaya dalam mengidentifikasi sifat-sifat kompleks yang terkait dengan variasi genetik.
