-
Urutan Genom Tumbuhan/Hewan De novo
De novosekuensing mengacu pada konstruksi seluruh genom spesies menggunakan teknologi sekuensing, misalnya PacBio, Nanopore, NGS, dll., tanpa genom referensi.Peningkatan yang luar biasa dalam panjang baca teknologi sekuensing generasi ketiga telah membawa peluang baru dalam merakit genom kompleks, seperti yang memiliki heterozigositas tinggi, rasio daerah berulang yang tinggi, poliploid, dll. Dengan panjang baca pada tingkat puluhan kilobase, pembacaan sekuensing ini memungkinkan penyelesaian elemen berulang, daerah dengan konten GC abnormal dan daerah lain yang sangat kompleks.
Platform： PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq6000
-
Majelis Genom berbasis Hi-C
Hi-C adalah metode yang dirancang untuk menangkap konfigurasi kromosom dengan menggabungkan probing interaksi berbasis kedekatan dan sekuensing throughput tinggi.Intensitas interaksi ini diyakini berkorelasi negatif dengan jarak fisik pada kromosom.Oleh karena itu, data Hi-C dapat memandu pengelompokan, pemesanan, dan orientasi urutan yang dirakit dalam rancangan genom dan mengaitkannya ke sejumlah kromosom tertentu.Teknologi ini memberdayakan perakitan genom tingkat kromosom tanpa adanya peta genetik berbasis populasi.Setiap genom tunggal membutuhkan Hi-C.
Platform：Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Genetika Evolusioner
Genetika evolusioner adalah layanan pengurutan yang dikemas yang dirancang untuk memberikan interpretasi komprehensif tentang informasi evolusioner dari materi yang diberikan berdasarkan variasi genetik, termasuk SNP, InDels, SV, dan CNV.Ini menyediakan semua analisis mendasar yang diperlukan untuk menggambarkan perubahan evolusioner dan fitur genetik populasi, seperti struktur populasi, keragaman genetik, hubungan filogeni, dll. Ini juga berisi studi tentang aliran gen, yang memberdayakan estimasi ukuran populasi efektif, waktu divergensi.
-
genomik komparatif
Genom komparatif secara harfiah berarti membandingkan urutan genom lengkap dan struktur spesies yang berbeda.Disiplin ini bertujuan untuk mengungkap evolusi spesies, fungsi gen, mekanisme pengaturan gen pada tingkat genom dengan mengidentifikasi struktur urutan dan elemen yang dilestarikan atau dibedakan di berbagai spesies.Studi genomik komparatif yang khas mencakup analisis dalam keluarga gen, perkembangan evolusioner, duplikasi genom keseluruhan, tekanan selektif, dll.
-
Analisis Segregan Massal
Analisis segregant massal (BSA) adalah teknik yang digunakan untuk mengidentifikasi penanda genetik terkait fenotipe dengan cepat.Alur kerja utama BSA berisi pemilihan dua kelompok individu dengan fenotipe yang sangat berlawanan, menyatukan DNA semua individu untuk membentuk dua bagian terbesar DNA, mengidentifikasi urutan diferensial antara dua kumpulan.Teknik ini telah digunakan secara luas dalam mengidentifikasi penanda genetik yang sangat terkait dengan gen yang ditargetkan dalam genom tanaman/hewan.
