Genom Jamur

Teknologi Biomarker menyediakan survei genom, genom halus, dan genom jamur lengkap tergantung pada tujuan penelitian tertentu.Pengurutan genom, perakitan, dan anotasi fungsional dapat dicapai dengan menggabungkan pengurutan generasi berikutnya + pengurutan generasi ketiga untuk mencapai perakitan genom tingkat tinggi.Teknologi Hi-C juga dapat digunakan untuk memfasilitasi perakitan genom pada tingkat kromosom.

Platform:Sekuel PacBio II

Nanopore Prometion P48

Platform Iluminasi NovaSeq

Hubungi kami

Detail Layanan

Hasil Demo

Keunggulan Layanan

● Berbagai strategi pengurutan tersedia untuk tujuan penelitian yang berbeda

● Sangat berpengalaman dalam perakitan genom jamur dengan lebih dari 10.000 genom lengkap yang telah dirakit.

● Tim dukungan teknis purna jual yang profesional memenuhi kebutuhan penelitian yang lebih spesifik.

Spesifikasi Layanan

Melayani	Strategi Pengurutan	Kualitas terjamin	Perkiraan waktu penyelesaian
Peta halus jamur	Menerangi 50X+Nanopori 100X	Konfigurasi N50≥2 Mb	35 hari kerja
Peta halus jamur	PacBio HiFi 30X	Konfigurasi N50≥2 Mb	35 hari kerja
Peta lengkap pene jamur	Menerangi 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X	Rasio penahan kromosom >90%	45 hari kerja

Analisis bioinformatika

● Kontrol kualitas data mentah

● Perakitan genom

● Analisis komponen genom

● Anotasi fungsi gen

● Analisis genomik komparatif

Persyaratan Sampel dan Pengiriman

Persyaratan Sampel:

UntukEkstrak DNA:

Jenis Sampel	Jumlah	Konsentrasi	Kemurnian
Ekstrak DNA	＞ 1,2 mcg	＞ 20 ng/μl	OD260/280= 1,6-2,5

Untuk sampel jaringan:

Jenis sampel

Perawatan sampel yang direkomendasikan

Penyimpanan dan pengiriman sampel

Jamur Uniseluler

Amati ragi di bawah mikroskop dan kumpulkan dalam fase eksponensialnya

Pindahkan kultur (mengandung sekitar 3-4.5e9 sel) ke dalam eppendorf 1,5 atau 2 ml.(Tetap di atas es)

Sentrifugasi tabung selama 1 menit pada 14000 g untuk mengumpulkan bakteri dan membuang supernatan dengan hati-hati

Tutup tabung dan bekukan bakteri dalam nitrogen cair setidaknya selama 1-3 jam.Simpan tabung di lemari es -80 ℃.

Bekukan sampel dalam nitrogen cair selama 3-4 jam dan simpan dalam nitrogen cair atau -80 derajat untuk reservasi jangka panjang.Diperlukan pengiriman sampel dengan es kering.

Jamur Makro

Jaringan dalam fase pertumbuhan aktif dianjurkan.

Bilas jaringan dengan air bebas endotoksin, lalu etonal 70%.

Simpan sampel dalam tabung cryo.