Salah satu ciri hortikultura penting yang membedakan jeruk pusar dengan varietas jeruk manis lainnya adalah adanya pusar pada buahnya.Ciri ini juga menjadi kriteria penting dalam klasifikasi varietas hortikultura jeruk manis.
Klien BMKGENE memanfaatkan teknologi sequencing SLAF yang dikembangkan sendiri oleh BMKGENE untuk melakukan penelitian bertajuk “Penambangan Gen Terkait Kualitas Buah pada Jeruk Manis Berdasarkan Urutan Fragmen yang Diperkuat Lokus Tertentu.“
Penelitian ini melibatkan pengurutan 240 sumber plasma nutfah jeruk manis dengan keragaman genetik yang luas dan asal geografis yang berbeda, menghasilkan 497,82 Mb data bacaan singkat.Analisis data menghasilkan 1.467.968 genotipe SNP di seluruh genom.Dengan menggunakan analisis Fst, penelitian ini mengidentifikasi 6 kandidat gen yang berkaitan dengan keberadaan pusar, berat buah, dan keasaman yang dapat dititrasi, sehingga memberikan dasar untuk perbaikan yang ditargetkan pada varietas jeruk manis.
Untuk pengurutan populasi skala besar, pengurutan fragmen yang diperkuat lokus spesifik (SLAF) lebih hemat biaya dan efektif tinggi dibandingkan dengan pengurutan seluruh genom (WGS).
KlikDi Siniuntuk mempelajari lebih lanjut tentang penelitian ini.
Waktu posting: 05-Des-2023