● Sangat Berpengalaman: Lebih dari 200.000 sampel telah diproses di BMK yang mencakup beragam jenis sampel, termasuk kultur sel, jaringan, cairan tubuh, dll. dan lebih dari 7.000 proyek mRNA-Seq ditutup yang mencakup berbagai bidang penelitian.
● Sistem kendali mutu yang ketat: Titik kendali mutu inti pada seluruh langkah termasuk penyiapan sampel, penyiapan perpustakaan, pengurutan, dan bioinformatika berada di bawah pengawasan ketat untuk memberikan hasil berkualitas tinggi.
● Berbagai database tersedia untuk anotasi fungsi dan studi pengayaan guna memenuhi beragam tujuan penelitian.
● Layanan purna jual: Layanan purna jual berlaku selama 3 bulan setelah proyek selesai, termasuk tindak lanjut proyek, pemecahan masalah, tanya jawab hasil, dll.
Perpustakaan | Strategi pengurutan | Data direkomendasikan | Kontrol kualitas |
Poli A diperkaya | Menerangi PE150 | 6 GB | Q30≥85% |
Nukleotida:
Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein atau DNA terbatas atau tidak ada pada gel. | Untuk tanaman: RIN≥6.5; Untuk hewan: RIN≥7.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevasi dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
Jaringan: Berat (kering):≥1 gram
*Untuk jaringan yang lebih kecil dari 5 mg, kami menyarankan untuk mengirimkan sampel jaringan beku (dalam nitrogen cair).
Suspensi sel:Jumlah sel = 3×106- 1×107
*Kami menyarankan untuk mengirimkan lisat sel beku.Jika jumlah sel tersebut lebih kecil dari 5×105.
Sampel darah:Volume≥1 ml
Mikroorganisme:Massa ≥ 1 gram
Wadah: tabung centrifuge 2 ml (tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Contoh pelabelan: Grup+replikasi misalnya A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Pengiriman:
Bioinformatika
Eukariotik Alur kerja analisis sekuensing mRNA
Bioinformatika
ØKontrol kualitas data mentah
ØPenyelarasan genom referensi
ØAnalisis struktur transkrip
ØKuantifikasi ekspresi
ØAnalisis ekspresi diferensial
ØAnotasi dan pengayaan fungsi
1.Kurva Saturasi Data mRNA
2.Analisis ekspresi diferensial-plot gunung berapi
3.Anotasi KEGG pada DEG
4.Klasifikasi GO pada DEG