●Platform:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Sepuluh dan BGI-DNB-T7
●Mode pengurutan:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kontrol kualitas perpustakaan sebelum pengurutan
●Urutan pengiriman data dan QC:pengiriman laporan QC dan data mentah dalam format fastq setelah demultiplexing dan memfilter pembacaan Q30.
●Fleksibilitas layanan Pengurutan:pelanggan dapat memilih untuk mengurutkannya berdasarkan jalur, sel aliran, atau jumlah data.
●Fleksibilitas platform:Perpustakaan DNB dapat ditransfer ke platform Illumina
●Pengalaman luas pada platform pengurutan Illumina:dengan ribuan proyek tertutup dengan berbagai spesies.
●Pengiriman laporan QC pengurutan:dengan metrik kualitas, keakuratan data, dan kinerja proyek pengurutan secara keseluruhan.
●Proses pengurutan yang matang:dengan waktu penyelesaian yang singkat.
●Kontrol Kualitas yang Ketat: kami menerapkan persyaratan QC yang ketat untuk menjamin pemberian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
Jumlah Data (X) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nm | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nm | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nm | ≥ 20 μl |
Platform | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Sepuluh | ≥ 2 nm | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nm | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nm | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nm | ≥ 25 μl |
Selain konsentrasi dan jumlah total, diperlukan juga pola puncak yang sesuai.
Laporan kualitas perpustakaan diberikan sebelum pengurutan, penilaian jumlah perpustakaan, dan fragmentasi.
Tabel 1. Statistik pengurutan data.
Contoh ID | BMKID | Bacaan mentah | Data Mentah (bp) | Bacaan bersih (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas sepanjang bacaan di setiap sampel
Gambar 2. Distribusi konten dasar
Gambar 3. Distribusi konten yang dibaca dalam pengurutan data