sequencing circRNA-Illumina
Fitur
● penipisan rRNA diikuti dengan persiapan perpustakaan terarah, memungkinkan pengurutan data yang spesifik untuk untai.
● Alur kerja bioinformatik memungkinkan prediksi sirkRNA dan kuantifikasi ekspresi
Keunggulan Layanan
●Perpustakaan RNA yang lebih komprehensif:kami menggunakan penipisan rRNA alih-alih penipisan RNA linier dalam persiapan pra-perpustakaan kami, memastikan bahwa data pengurutan tidak hanya mencakup circRNA tetapi juga mRNA dan lncRNA, sehingga memungkinkan analisis bersama pada kumpulan data ini
●Analisis opsional jaringan RNA endogen kompetitif (ceRNA).: memberikan wawasan lebih dalam tentang mekanisme pengaturan seluler
●Keahlian yang Luas: dengan rekam jejak pemrosesan lebih dari 20.000 sampel di BMK, yang mencakup beragam jenis sampel dan proyek lncRNA, tim kami membawa segudang pengalaman ke setiap proyek.
●Kontrol Kualitas yang Ketat: kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahapan, mulai dari persiapan sampel dan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika.Pemantauan yang cermat ini memastikan penyampaian hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
● Dukungan Pasca Penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan masa layanan purna jual 3 bulan.Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menjawab pertanyaan apa pun terkait hasil.
Persyaratan Sampel dan Pengiriman
| Perpustakaan | Platform | Data yang direkomendasikan | QC Data |
| Poli A diperkaya | Menerangi PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Konsentrasi (ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 100 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Kontaminasi protein atau DNA terbatas atau tidak ada pada gel. | Untuk tanaman: RIN≥6.5; Untuk hewan: RIN≥7.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; elevasi dasar yang terbatas atau tidak ada sama sekali |
● Tanaman:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1,2 gram
● Hewan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Jeroan atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1,5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Krustasea: 450mg
● Darah utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma: 6ml
Pengiriman Sampel yang Direkomendasikan
Wadah: tabung centrifuge 2 ml (tidak disarankan menggunakan kertas timah)
Contoh pelabelan: Grup+replikasi misalnya A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel harus dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNAstabil: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNAstable®) dan dikirim dalam suhu kamar.
Alur Kerja Layanan
Desain percobaan
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Pembangunan perpustakaan
Pengurutan
Analisis data
Layanan purna jual
Bioinformatika
prediksi circRNA: distribusi kromosom
CirRNA yang Dinyatakan Berbeda – Plot gunung berapi
CirRNA yang Dinyatakan Secara Berbeda – pengelompokan hierarki
Pengayaan fungsional gen inang circRNA
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan pengurutan circRNA BMKGene melalui koleksi publikasi yang dikurasi.
Wang, X. dkk.(2021) 'CPSF4 mengatur pembentukan sirkRNA dan pembungkaman gen yang dimediasi mikroRNA pada karsinoma hepatoseluler', Onkogen 2021 40:25, 40(25), hlm.4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. dkk.(2023) 'Transkriptome responsif X oo mengungkapkan peran RNA133 sirkular dalam resistensi penyakit dengan mengatur ekspresi OsARAB dalam beras', Penelitian Fitopatologi, 5(1), hlm.1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/GAMBAR/6.
Y, H. dkk.(2023) 'CPSF3 memodulasi keseimbangan transkrip sirkular dan linier pada karsinoma hepatoseluler'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. dkk.(2023) 'Evaluasi komprehensif sirkRNA pada kardiomiopati sirosis sebelum dan sesudah transplantasi hati', Imunofarmakologi Internasional, 114, hal.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
