Ապրանքներ

Միակ միջուկային ՌՆԹ-ի հաջորդականություն

Միակ միջուկային ՌՆԹ-ի հաջորդականության ընդգծված պատկեր

Մեկ բջիջների գրավման և անհատական գրադարանների կառուցման տեխնիկայի առաջընթացը, որը զուգորդվում է բարձր թողունակությամբ հաջորդականության հետ, թույլ է տալիս գեների արտահայտման ուսումնասիրություններ բջիջ առ բջիջ:Այն թույլ է տալիս ավելի խորը և ամբողջական համակարգային վերլուծություն կատարել բարդ բջիջների պոպուլյացիաների վրա, որոնցում հիմնականում խուսափում է դրանց տարասեռությունը քողարկելուց՝ հաշվի առնելով բոլոր բջիջների միջինը:

Այնուամենայնիվ, որոշ բջիջներ հարմար չեն միաբջջային կասեցման պատրաստման համար, ուստի անհրաժեշտ են նմուշի պատրաստման այլ մեթոդներ՝ միջուկի արդյունահանումը հյուսվածքներից, այսինքն՝ միջուկը ուղղակիորեն հանվում է հյուսվածքներից կամ բջջից և պատրաստվում է մեկ միջուկային կասեցման՝ մեկ-միջուկի համար: բջիջների հաջորդականություն.

BMK-ն տրամադրում է 10× Genomics ChromiumTM-ի վրա հիմնված միաբջիջ ՌՆԹ-ի հաջորդականացման ծառայություն:Այս ծառայությունը լայնորեն օգտագործվել է հիվանդությունների հետ կապված հետազոտությունների համար, ինչպիսիք են իմունային բջիջների տարբերակումը, ուռուցքի տարասեռությունը, հյուսվածքների զարգացումը և այլն:

Տարածական տրանսկրիպտոմային չիպ՝ 10× Genomics

Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ

Կապ մեզ հետ

Ծառայության մանրամասները

Կենսաինֆորմատիկա

Դեմո արդյունքներ

Տեխնիկական սկզբունք

Միջուկների մեկուսացումը կատարվում է 10× Genomics ChromiumTM-ի միջոցով, որը բաղկացած է ութ-ալիքային միկրոհեղուկ համակարգից՝ կրկնակի հատումներով:Այս համակարգում շտրիխ կոդերով և այբբենարանով գելային ուլունքները, ֆերմենտները և մեկ միջուկը պարփակվում են նանոլիտրի չափ յուղի կաթիլում՝ առաջացնելով Gel Bead-in-Emulsion (GEM):Երբ GEM-ը ձևավորվում է, յուրաքանչյուր GEM-ում կատարվում է բջիջների լիզում և շտրիխ կոդերի թողարկում:mRNA-ն հակադարձ տառադարձվում է cDNA մոլեկուլների՝ 10× շտրիխ կոդերով և UMI-ով, որոնք հետագայում ենթակա են ստանդարտ հաջորդականության գրադարանի կառուցմանը:

Հյուսվածքը հարմար չէ միաբջջային կասեցման պատրաստման համար

Բջջային / Հյուսվածք	Պատճառ
Չթարմացրեք սառեցված հյուսվածքը	Հնարավոր չէ ստանալ թարմ կամ երկար ժամանակ պահպանված կազմակերպություններ
Մկանային բջիջ, մեգակարիոցիտ, ճարպ…	Բջջի տրամագիծը չափազանց մեծ է գործիք մտնելու համար
Լյարդ…	Չափազանց փխրուն է կոտրելու համար, անկարող է տարբերակել առանձին բջիջները
Նեյրոնային բջիջ, ուղեղ…	Ավելի զգայուն, հեշտ սթրեսի համար, կփոխի հաջորդականության արդյունքները
Ենթաստամոքսային գեղձ, վահանաձև գեղձ…	Հարուստ է էնդոգեն ֆերմենտներով, որոնք ազդում են միայնակ բջջային կասեցման արտադրության վրա

Միակ միջուկ ընդդեմ միաբջիջ

Միակ միջուկ	Միաբջիջ
Անսահմանափակ բջջային տրամագիծ	Բջջի տրամագիծը՝ 10-40 մկմ
Նյութը կարող է լինել սառեցված հյուսվածք	Նյութը պետք է լինի թարմ հյուսվածք
Սառեցված բջիջների ցածր սթրեսը	Ֆերմենտային բուժումը կարող է առաջացնել բջիջների սթրեսային ռեակցիա
Կարիք չկա արյան կարմիր բջիջների հեռացում	Կարմիր արյան բջիջները պետք է հեռացվեն
Միջուկային էքսպրես բիոինֆորմացիա	Ամբողջ բջիջն արտահայտում է բիոինֆորմացիա