Հարթակ՝ NovaSeq հարթակ, PE150
Գրադարանի տեսակը. 200-400bp ներդիր բիսուլֆիտով մշակված ԴՆԹ գրադարան
Հերթականացման ռազմավարություն՝ Զուգակցված-End 150 bp
Առաջարկեք տվյալների թողարկում՝ 10 Գբ հում տվյալներ/նմուշ
ԴՆԹ-ի քանակը՝ ≥ 2 մգ
ԴՆԹ-ի կոնցենտրացիան՝≥ 20ng/μl:
Մաքրություն՝ OD260/280 = 1,8-ից 2,0 առանց քայքայման կամ ՌՆԹ-ի աղտոտման
a.Հղում գենոմի հավասարեցման վիճակագրություն
Կարդում է քարտեզագրման վիճակագրությունը
SԳ տեղամասի հաջորդականության խորության և ծածկույթի վիճակագրություն
Aկուտակված ծածկույթ
Dյուրաքանչյուր նմուշի յուրացման արդյունավետությունը
b.Մեթիլացման տեղամասի հայտնաբերում
Մեթիլացման մակարդակների ցանկ C տեղամասում
BS փոխակերպում
c.Մեթիլացման քարտեզ
Genome տարր
d.Նմուշների միջև մեթիլացման մակարդակների համեմատությունը
PCG մեթիլացման օդային հարաբերակցությունը
d.Դիֆերենցիալ մեթիլացման վերլուծություն
SDMR-ի վիճակագրություն