Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ, PE150
Գրադարանի տեսակը՝ 350bp ներդիր cDNA գրադարան (կախված է առավելագույն բաշխումից)
Հերթականացման ռազմավարություն՝ Զուգակցված-End 150 bp
Առաջարկվող տվյալների քանակը՝ 2 Գբ հում տվյալներ/նմուշ
(1) Տվյալների հաջորդականության որակի վերահսկում. նուկլեոտիդների բաշխում, բազային որակի բաշխում, rRNA հարաբերակցության գնահատում;
(2) Հերթականության հավասարեցման վերլուծություն. Հավասարեցման արդյունքների վիճակագրություն, հաջորդականության հագեցվածություն, հաջորդականության ծածկույթ;
(3) Հղման գենոմի անոտացիա (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) Արտահայտման վերլուծություն. արտահայտման բաշխում (երկու կամ ավելի նմուշներով), նմուշների միջև արտահայտության վերլուծություն (Վենի անալիզ, հարաբերակցական վերլուծություն, PCA վերլուծություն);
(5) Դիֆերենցիալ արտահայտությունների վերլուծություն (երկու կամ ավելի նմուշներով).
(6) Գենային հավաքածուի վերլուծություն. Վենի վերլուծություն, Կլաստերային վերլուծություն, Ֆունկցիոնալ անոտացիայի վերլուծություն (COG, GO, KEGG), Ֆունկցիայի հարստացման վերլուծություն (GO, KEGG), Ֆունկցիայի հարստացման ակորդային գրաֆիկ, Ipath վերլուծություն;
(7) sRNA վերլուծություն. sRNA կանխատեսում, sRNA անոտացիա (Blast, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA երկրորդական կառուցվածքի կանխատեսում, sRNA թիրախ գենի կանխատեսում;
(8) Տառագրի կառուցվածքի վերլուծություն. օպերոնի վերլուծություն, Տառադարձման սկզբի և ավարտի վայրերի կանխատեսում, UTR ծանոթագրություն և վերլուծություն, խթանողի հաջորդականության կանխատեսում, SNP/InDel վերլուծություն (SNP/InDel անոտացիա, SNP/InDel տարածաշրջանային բաշխում, SNP վիճակագրություն):