-
Քրոմատինի իմունային նստվածքների հաջորդականություն (ChIP-seq)
ChIP-Seq-ն ապահովում է ԴՆԹ-ի թիրախների գենոմի ողջ պրոֆիլավորումը հիստոնների ձևափոխման, տրանսկրիպցիոն գործոնների և ԴՆԹ-ի հետ կապված այլ սպիտակուցների համար:Այն համատեղում է քրոմատինի իմունային տեղումների (ChIP) ընտրողականությունը՝ սպիտակուց-ԴՆԹ-ի հատուկ բարդույթները վերականգնելու համար, հաջորդ սերնդի հաջորդականության (NGS) հզորությամբ՝ վերականգնված ԴՆԹ-ի բարձր թողունակությամբ հաջորդականացման համար:Բացի այդ, քանի որ սպիտակուց-ԴՆԹ կոմպլեքսները վերականգնվում են կենդանի բջիջներից, կապող վայրերը կարող են համեմատվել տարբեր տեսակի բջիջներում և հյուսվածքներում կամ տարբեր պայմաններում:Դիմումները տատանվում են տրանսկրիպցիոն կարգավորումից մինչև հիվանդության մեխանիզմների զարգացման ուղիները և դրանից դուրս:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ
-
Ամբողջ գենոմի բիսուլֆիտի հաջորդականությունը
Ցիտոզինում (5-mC) հինգերորդ դիրքում ԴՆԹ-ի մեթիլացումը հիմնարար ազդեցություն ունի գեների արտահայտման և բջջային ակտիվության վրա:Մեթիլացման աննորմալ ձևերը կապված են մի շարք պայմանների և հիվանդությունների հետ, ինչպիսիք են քաղցկեղը:WGBS-ը դարձել է ոսկե ստանդարտ՝ գենոմի լայնածավալ մեթիլացման ուսումնասիրության համար մեկ բազային լուծաչափով:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ
-
Տրանսպոզազային հասանելի քրոմատինի վերլուծություն՝ բարձր թողունակության հաջորդականությամբ (ATAC-seq)
ATAC-seq-ը գենոմի լայնածավալ քրոմատինի հասանելիության վերլուծության բարձր թողունակության հաջորդականության մեթոդ է, որը կարևոր է գեների արտահայտման գլոբալ էպիգենետիկ վերահսկման համար:Հերթականացման ադապտերները տեղադրվում են բաց քրոմատինային շրջաններում հիպերակտիվ Tn5 տրանսպոզազայի միջոցով:PCR ուժեղացումից հետո կառուցվում է հաջորդականության գրադարան:Բոլոր բաց քրոմատինային շրջանները կարելի է ձեռք բերել որոշակի տարածա-ժամանակային պայմանով, որը չի սահմանափակվում միայն տրանսկրիպցիոն գործոնի կապակցման վայրերով կամ որոշակի հիստոնային փոփոխված շրջանով:
-
Կրճատված ներկայացուցչական բիսուլֆիտի հաջորդականություն (RRBS)
ԴՆԹ մեթիլացման հետազոտությունը միշտ եղել է հիվանդության հետազոտության թեժ թեմա և սերտորեն կապված է գեների արտահայտման և ֆենոտիպային գծերի հետ:RRBS-ը ճշգրիտ, արդյունավետ և խնայող մեթոդ է ԴՆԹ-ի մեթիլացման հետազոտության համար:Պրոմոտորի և CpG կղզու շրջանների հարստացումը ֆերմենտային կտրվածքով (Msp I), զուգորդված բիսուլֆիտի հաջորդականությամբ, ապահովում է բարձր լուծաչափով ԴՆԹ մեթիլացման հայտնաբերում:
Պլատֆորմ՝ Illumina NovaSeq հարթակ
