BMKCloud Log in
条形 banner-03

Նորություններ

T2T ԳԵՆՈՄԻ ՀԱՎԱՔՈՒՄ, ԳԱՊ ԱԶԱՏ ԳԵՆՈՄ

1stԵրկու բրնձի գենոմ1

Վերնագիր. Xian/indica բրնձի համար երկու առանց բացթողման գենոմների հավաքում և վավերացում, որը բացահայտում է բույսերի կենտրոնական ճարտարապետության պատկերացումները

Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073

Տեղադրման ժամանակը՝ հունվարի 01, 2021 թ.

Ինստիտուտ: Huazhong գյուղատնտեսական համալսարան, Չինաստան

Նյութեր

O. sativa xian/indicaբրնձի տեսակներ «Zhenshan 97 (ZS97)» և «Minghui 63 (MH63)

Հերթականության ռազմավարություն

NGS ընթերցումներ + HiFi ընթերցումներ + CLR ընթերցումներ + BioNano + Hi-C

Տվյալներ:

ZS97՝ 8,34 Գբ (~ 23x) HiFi ընթերցում + 48,39 Գբ (~ 131x ) CLR ընթերցում + 25 Գբ (~ 69x) NGS + 2 BioNano Irys բջիջ

MH63՝ 37,88 Գբ (~ 103x) HiFi ընթերցում + 48,97 Գբ (~ 132x) CLR ընթերցում + 28 Գբ (~ 76x) NGS + 2 BioNano Irys բջիջ

Գծապատկեր-1

Նկար 1 Բրնձի երկու բաց գենոմներ (MH63 և ZS97)

2ndԲանանի գենոմ2

Վերնագիր՝ բանանի տելոմերից տելոմեր առանց բացթողումների քրոմոսոմներ՝ օգտագործելով նանոպորների հաջորդականությունը

Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

Տեղադրման ժամանակը ՝ 17 ապրիլի, 2021 թ.

Ինստիտուտ: Université Paris-Saclay, Ֆրանսիա

Նյութեր

Կրկնակի հապլոիդՄուսա ակումինատաsppմալակցենսիս(ԴՀ-Պահանգ)

Հերթականության ռազմավարություն և տվյալներ.

HiSeq2500 PE250 ռեժիմ + MinION/ PromethION (93 Գբ, ~ 200X )+ Օպտիկական քարտեզ (DLE-1+BspQ1)

Աղյուսակ 1 Musa acuminata (DH-Pahang) գենոմի հավաքների համեմատություն

Աղյուսակ1-GRCh38-and-T2T-CHM13-human-genome-assemblies-ի համեմատություն
Նկար-Մուսա-գենոմներ-ճարտարապետություն-համեմատություն

Նկար 2 Մուսայի գենոմների ճարտարապետության համեմատություն

3rdPhaeodactylum tricornutum գենոմը3

Վերնագիր. Telomere-to-telomere genome assembly ofP
haeodactylum tricornutum

Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

Տեղադրման ժամանակը՝ մայիսի 04, 2021թ

Ինստիտուտ: Արևմտյան համալսարան, Կանադա

Նյութեր

Phaeodactylum tricornutum(Culture Collection of Algae and Protozoa CCAP 1055/1)

Հերթականության ռազմավարություն և տվյալներ.

1 Oxford Nanopore minION հոսքի բջիջ + 2×75 զուգակցված վերջի միջին ելքային NextSeq 550 գործարկում

Figure-Workflow-for-telomere-to-telomere-genome-assembly-1-1024x740

Նկար 3 Աշխատանքային ընթացք տելոմեր-տելոմեր գենոմի հավաքման համար

4thՄարդու CHM13 գենոմը4

Վերնագիր՝ Մարդու գենոմի ամբողջական հաջորդականությունը

Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

Տեղադրման ժամանակը՝ մայիսի 27, 2021թ

Ինստիտուտ: Առողջապահության ազգային ինստիտուտներ (NIH), ԱՄՆ

Նյութեր՝ բջջային գիծ CHM13

Հերթականության ռազմավարություն և տվյալներ.

30× PacBio շրջանաձև կոնսենսուսային հաջորդականություն (HiFi), 120× Oxford Nanopore ծայրահեղ երկար ընթերցման հաջորդականություն, 100× Illumina PCR-Free հաջորդականություն (ILMN), 70× Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-Ctical), եւ Strand-seq

Աղյուսակ 2 GRCh38 և T2T-CHM13 մարդու գենոմի հավաքների համեմատություն

Table-Comparison-of-Musa-acuminata-DH-Pahang-genome-assemblies

Հղում

1.Սերգեյ Նուրք և այլք.Մարդու գենոմի ամբողջական հաջորդականությունը.bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798

2.Քերոլայն Բելսեր և այլք.Բանանի տելոմեր-տելոմեր առանց բացթողումների քրոմոսոմներ՝ օգտագործելով նանոպորների հաջորդականությունը:bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017

3.Daniel J. Giguere et al.Phaeodactylum tricornutum-ի տելոմերից տելոմեր գենոմի հավաքում:bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596

4. Jia-Ming Song et al.Xian/indica բրնձի համար երկու բացթողումներ չունեցող գենոմների հավաքում և վավերացում բացահայտում է բույսերի ցենտրոմերային ճարտարապետության պատկերացումները:bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073


Հրապարակման ժամանակը՝ Հունվար-06-2022

Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.