ԳԵՆՈՄ
Կենսազանգվածի Miscanthus lutarioriparius գենոմի քրոմոսոմային մասշտաբով հավաքում և վերլուծություն
Nanopore sequenceing |Illumina |Hi-C |ՌՆԹ-հաջորդականություն |Ֆիլոգենիա
Այս ուսումնասիրության ընթացքում Biomarker Technologies-ը տեխնիկական աջակցություն է տրամադրել Nanopore-ի հաջորդականացման, de novo գենոմի հավաքման, Hi-C օժանդակությամբ հավաքման և այլնի վերաբերյալ:
Վերացական
Միսկանթուս, կոճղարմատավոր բազմամյա բույս, ունի կենսաէներգիայի արտադրության մեծ ներուժ՝ իր բարձր կենսազանգվածի և սթրեսային հանդուրժողականության պատճառով:Մենք հայտնում ենք քրոմոսոմային մասշտաբի հավաքման մասինMiscanthus lutarioripariusգենոմը՝ համատեղելով Oxford Nanopore հաջորդականությունը և Hi-C տեխնոլոգիաները:2.07-Gb մոնտաժը ծածկում է գենոմի 96.64%-ը, իսկ N50 կոնտիգը կազմում է 1.71 Մբ:Ցենտրոմերների և տելոմերների հաջորդականությունները հավաքվում են համապատասխանաբար բոլոր 19 քրոմոսոմների և 10-րդ քրոմոսոմների համար։M. lutarioriparius-ի ալոտետրապլոիդ ծագումը հաստատվում է ցենտրոմերային արբանյակային կրկնությունների միջոցով:Հստակորեն դրսևորվում են տետրապլոիդ գենոմի կառուցվածքը և մի քանի քրոմոսոմային վերադասավորումներ՝ կապված սորգոյի հետ:Տանդեմ կրկնվող գեներիM. lutarioripariusֆունկցիոնալ հարստացված են ոչ միայն սթրեսի արձագանքման, այլև բջջային պատի կենսասինթեզի առումով:Հիվանդությունների դիմադրության, բջջային պատի կենսասինթեզի և մետաղի իոնների տեղափոխման հետ կապված գենային ընտանիքները մեծապես ընդլայնվել և զարգացել են:Այս ընտանիքների ընդլայնումը կարող է կարևոր գենոմային հիմք հանդիսանալ ուշագրավ հատկությունների ընդլայնման համարM. lutarioriparius.
Գենոմի հավաքման հիմնական վիճակագրությունը
Նկար.M. lutarioriparius գենոմի հավաքման ակնարկ
Նորություններ և կարևոր իրադարձություններ նպատակն է կիսել վերջին հաջողված դեպքերը Biomarker Technologies-ի հետ՝ ֆիքսելով նոր գիտական ձեռքբերումները, ինչպես նաև ուսումնասիրության ընթացքում կիրառվող նշանավոր տեխնիկան:
Հրապարակման ժամանակը՝ Հունվար-05-2022