Գենոմի լայն ասոցիացիայի ուսումնասիրությունը (GWAS) նպատակ ունի բացահայտելու գենետիկ տարբերակները (գենոտիպը), որոնք կապված են հատուկ հատկությունների (ֆենոտիպի) հետ:GWA-ի ուսումնասիրությունները ուսումնասիրում են գենետիկական մարկերները, որոնք հատում են մեծ թվով անհատների ամբողջ գենոմը և կանխատեսում են գենոտիպ-ֆենոտիպ ասոցիացիաները՝ բնակչության մակարդակով վիճակագրական վերլուծության միջոցով:Ամբողջ գենոմի վերասեկվենցիան կարող է պոտենցիալ բացահայտել բոլոր գենետիկ տարբերակները:Ֆենոտիպային տվյալների հետ զուգակցվելով՝ GWAS-ը կարող է մշակվել՝ բացահայտելու ֆենոտիպին առնչվող SNP-ները, QTL-ները և թեկնածու գեները, ինչը մեծապես պաշտպանում է ժամանակակից կենդանիների/բույսերի բուծումը:SLAF-ը ինքնուրույն մշակված պարզեցված գենոմի հաջորդականության ռազմավարություն է, որը բացահայտում է գենոմի ամբողջ բաշխված մարկերները՝ SNP:Այս SNP-ները, որպես մոլեկուլային գենետիկական մարկերներ, կարող են մշակվել նպատակային հատկանիշներով ասոցիացիայի ուսումնասիրությունների համար:Դա ծախսարդյունավետ ռազմավարություն է գենետիկական տատանումների հետ կապված բարդ հատկանիշները բացահայտելու համար:
