BMKGENE-ը տրամադրել է տարածական տրանսկրիպտոմային հաջորդականության ծառայություններ «STEEL-ը թույլ է տալիս բարձր լուծաչափով սահմանազատել տարածական ժամանակային տրանսկրիպտոմիկ տվյալները», որը հրապարակվել է Briefings in Bioinformatics-ում:
Այս ուսումնասիրությունը առաջարկել է չվերահսկվող և բազմակի ուսուցման վրա հիմնված ալգորիթմ՝ Spatial Transcriptome cEll typE clustering (STEEL), որը նույնացնում է տարածական տրանսկրիպտոմից տիրույթները՝ խմբավորելով ուլունքները, որոնք ցուցադրում են և՛ խիստ նման գենային արտահայտման պրոֆիլներ, և՛ մոտ տարածական հեռավորություն գրաֆիկների ձևով:
STEEL-ի համապարփակ գնահատումը տարածական տրանսկրիպտոմիկ տվյալների հավաքածուների վրա 10X Visium պլատֆորմից ցույց է տալիս, որ այն ոչ միայն բարձր լուծում է ստանում մկնիկի ուղեղի նուրբ կառուցվածքները բնութագրելու համար, այլև հնարավորություն է տալիս առանձին վերլուծված հյուսվածքների բազմաթիվ սլայդների ինտեգրումը ավելի մեծի մեջ:
Տարածական տրանսկրիպտոմային տեխնոլոգիաների առաջընթացով մեր մեթոդը մեծ կիրառելիություն կունենա տիրույթի նույնականացման և գեների արտահայտման ատլասի վերակառուցման գործում:
Սեղմելայստեղայս ուսումնասիրության մասին ավելին իմանալու համար:
Հրապարակման ժամանակը՝ հոկտ-20-2023