Խորացրեք հետազոտական տեսակների վայրի բազմազանությունը ուսումնասիրելու ներուժը, որը օրինակելի է BMKGENE-ի հաճախորդների առանցքային դեպքով:Վերջերս հրապարակված Plant Biotechnology Journal-ի այս տարվա համարում, «Քրոմոսոմային մակարդակի Wild Hevea brasiliensis Genome. Empowering Genomic Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Rebber» վերնագրով հոդվածը արժեքավոր հղում է:
Բրազիլական կաուչուկի ծառը (Hevea brasiliensis) կանգնած է որպես բնական ռետինի առանցքային աղբյուր:Անցյալ դարի ընթացքում բուծման ավանդական մեթոդոլոգիաները կաուչուկի արտադրության ուշագրավ վեցապատիկ աճի պատճառ դարձան:Այնուամենայնիվ, հիմքում ընկած գենետիկական հիմքը, որը պատասխանատու է կաուչուկի պոտենցիալ բերքատվության բարձրացման համար, մնում է հանելուկային:
Այս ուսումնասիրությունը ձեռնամուխ եղավ վայրի կաուչուկի ծառի համար քրոմոսոմային մակարդակի գենոմի կառուցմանը, օգտագործելով Nanopore երկար ընթերցված հաջորդականությունը, Illumina NGS հաջորդականությունը և Hi-C տեխնոլոգիան:
Զուգահեռաբար, 147 գերմպլազմային ռեսուրսների շտեմարան, որը ներառում է բարձր բերքատվության տատանումներ, վայրի շտամներ և հարակից տեսակներ, հավաքվել է ամբողջ գենոմի համապարփակ վերահաշվարկի (WGS) համար՝ օգտագործելով Illumina հարթակը:Հետագա հաջորդականության տվյալները ենթարկվել են բնակչության գենետիկական խիստ վերլուծության՝ հնարավորություն տալով բաժանել բնակչության կառուցվածքը, բազմազանությունը և կապի անհավասարակշռությունը:Այս վերլուծությունը լույս է սփռում բնակչության ընտելացման տատանումների վրա:
Հետագա հետազոտությունները ներառում էին Fst, π, Tajima's D և LD վերլուծություններ, որոնց նպատակն էր բացահայտել ընտրության ազդանշանները, որոնք առաջանում են լատեքսի բարելավված եկամտաբերությունից, հատկապես կենտրոնանալով Wickham կլոնների վրա:
Ավարտվելով գենոմի ամբողջ ասոցիացիայի վերլուծությամբ (GWAS), նշվեցին մարկերներ, որոնք կապված են բերքատվության հատկանիշների և հետագայում բերքատվության հետ կապված գեների հետ:Նախնական վավերացումը բացահայտեց տարբեր մուտանտների տարբեր տրանսկրիպցիոն գործողությունները երկու ERF գեների համար՝ նախնական հայացք տրամադրելով դրանց ֆունկցիոնալ նշանակությանը:Հետագա հաստատումը նախատեսվում է առաջիկա հետազոտության շրջանակներում:
BMKGENE-ը հպարտանում է այս զգալի պոպուլյացիայի գենոմի լայնածավալ վերահերթափոխմանն աջակցելով, ինչպես նաև էական դերակատարում ունենալով կենսաինֆորմատիկական վերլուծության մեջ:Մեր հսկայական փորձը ներառում է NGS/TGS հաջորդականությունը և մուլտիոմիկական կենսաինֆորմատիկական վերլուծությունը 1000+ տեսակների զանգվածում:Մենք անհամբեր սպասում ենք ձեզ հետ համագործակցության հեռանկարին ձեր առաջիկա ծրագրերում:
Սեղմեք այստեղ, որպեսզիավելին իմանալ այս ուսումնասիրության մասին
Հրապարակման ժամանակը՝ օգոստոսի 29-2023