●Հարթակներ:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten և BGI-DNB-T7
●Հերթականության ռեժիմներ.PE50, PE100, PE150, PE250
●Գրադարանների որակի վերահսկում նախքան հաջորդականությունը
●Տվյալների հաջորդականության առաքում և QC.QC հաշվետվության և չմշակված տվյալների առաքում fastq ձևաչափով Q30 ընթերցումների դեմուլտիպլեքսավորումից և զտումից հետո:
●Հերթականության ծառայությունների բազմակողմանիություն.Հաճախորդը կարող է ընտրել հաջորդականությունը ըստ գծի, հոսքի բջիջի կամ տվյալների քանակի:
●Պլատֆորմների բազմակողմանիություն.DNB գրադարանները կարող են տեղափոխվել Illumina հարթակներ
●Մեծ փորձ Illumina հաջորդականության հարթակում.հազարավոր փակ նախագծերով տարբեր տեսակների հետ:
●Հերթական QC զեկույցի առաքում.որակի ցուցանիշներով, տվյալների ճշգրտությամբ և հաջորդականության նախագծի ընդհանուր կատարմամբ:
●Հասուն հաջորդականության գործընթացը.շրջադարձի կարճ ժամանակով:
●Որակի խիստ հսկողությունՄենք իրականացնում ենք QC-ի խիստ պահանջներ՝ հետևողականորեն բարձրորակ արդյունքների ապահովումը երաշխավորելու համար:
Տվյալների քանակը (X) | Համակենտրոնացում (qPCR/nM) | Ծավալը |
X ≤ 50 Գբ | ≥ 2 նմ | ≥ 20 մկլ |
50 Գբ ≤ X < 100 Գբ | ≥ 3 նՄ | ≥ 20 մկլ |
X ≥ 100 Գբ | ≥ 4 նՄ | ≥ 20 մկլ |
Հարթակ | Համակենտրոնացում (qPCR/nM) | Ծավալը |
HiSeq X Ten | ≥ 2 նմ | ≥ 20 մկլ |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 նմ | ≥ 25 մկլ |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 նՄ | ≥ 25 մկլ |
NovaSeq X | ≥ 1,5 նՄ | ≥ 25 մկլ |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 նՄ | ≥ 25 մկլ |
Բացի համակենտրոնացումից և ընդհանուր քանակից, պահանջվում է նաև համապատասխան գագաթնակետային օրինակ:
Գրադարանի որակի վերաբերյալ հաշվետվությունը տրվում է նախքան հաջորդականությունը, գրադարանի քանակությունը և մասնատումը գնահատելը:
Աղյուսակ 1. Տվյալների հաջորդականության վերաբերյալ վիճակագրություն:
Նմուշի ID | BMKID | Հում կարդում | Հում տվյալներ (bp) | Մաքուր ընթերցումներ (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
Նկար 1. Որակի բաշխում յուրաքանչյուր նմուշի ընթերցումների երկայնքով
Նկար 2. Բազային բովանդակության բաշխում
Նկար 3. Ընթերցված բովանդակության բաշխումը հաջորդականության տվյալների մեջ