Ապրանքներ

*Այստեղ ցուցադրված ցուցադրական արդյունքները բոլորը Biomarker Technologies-ով հրապարակված գենոմներից են

1.LTR ներդիրի ժամանակի գնահատում. Նկարը ցույց է տալիս եզակի երկմոդալ բաշխում LTR-RT-ների ներդրման ժամանակներում Weining տարեկանի գենոմում՝ համեմատած այլ տեսակների:Ամենավերջին գագաթը հայտնվել է մոտ 0,5 միլիոն տարի առաջ:

Լի Գուանգը և ուրիշներ,Բնության գենետիկա, 2021 թ

2. Ֆիլոգենիա և գենային ընտանիքի վերլուծություն շայոտի վրա (Sechium edule): Վերլուծելով շայոտը և գենային ընտանիքի մյուս 13 հարակից տեսակները, պարզվեց, որ շայոտը ամենամոտ կապ ունի օձի դդմի հետ (Trichosanthes anguina):Շայոտը, որը ստացվել է օձի դդումից մոտ 27-45 Mya-ում և ամբողջ գենոմի կրկնօրինակումը (WGD) նկատվել է շայոտում 25±4 Mya-ում, որը WGD-ի երրորդ իրադարձությունն է cucuibitaceae-ում:

Ֆու Ա և այլք,Այգեգործության հետազոտություն, 2021 թ

3. Սինթենի վերլուծություն. Պտղի զարգացման մեջ ֆիտոհորմոնների հետ կապված որոշ գեներ հայտնաբերվել են շայոտի, օձի դդմի և դդմի մեջ:Չայոտի և դդմի հարաբերակցությունը մի փոքր ավելի բարձր է, քան շայոտի և օձի դդմի միջև:

Ֆու Ա և այլք,Այգեգործության հետազոտություն, 2021 թ

4. Գեների ընտանիքի վերլուծություն. G.thurberi և G.davidsonii գենոմներում գենային ընտանիքի ընդլայնման և կծկման վրա KEGG-ի հարստացումը ցույց տվեց, որ ստերոիդների կենսասինթեզի և բրասինոստերոիդների կենսասինթեզի հետ կապված գեները ընդլայնվել են:

Յանգ Զ և այլք,BMC կենսաբանություն, 2021 թ

5. Ամբողջ գենոմի կրկնօրինակման վերլուծություն. 4DTV և Ks բաշխման վերլուծությունը ցույց է տվել ամբողջ գենոմի կրկնօրինակման իրադարձությունը:Ներտեսակի գագաթները ցույց են տվել կրկնօրինակման իրադարձություններ:Միջտեսակի գագաթները ցույց են տալիս տեսակավորման իրադարձությունները:Վերլուծությունը ցույց տվեց, որ համեմատելով մյուս երեք սերտորեն կապված տեսակների հետ՝ O. europaea-ն վերջերս անցել է լայնածավալ գենային կրկնօրինակման միջով:

Ռաո Գ և այլք,Այգեգործության հետազոտություն, 2021 թ

BMK գործ

Վարդ առանց փշոտի. գենոմային պատկերացումներ՝ կապված խոնավության հարմարվողականության հետ

Հրապարակված է: National Science Review, 2021 թ

Հերթականության ռազմավարություն.

― ԲեյսիԱնփուշ(Ռ.Վիչուրայնան) գենոմ.
Մոտ.93 X PacBio + մոտ.90 X Nanopore + 267 X Illumina

Հիմնական արդյունքներ

1. Բարձր որակի R.wichuraiana գենոմը կառուցվել է երկար ընթերցված հաջորդականության տեխնիկայի միջոցով, որը տալիս է 530,07 Մբ հավաքույթ (գենոմի գնահատված չափը եղել է մոտավորապես 525,9 Մբ ըստ հոսքի ցիտոմետրիայի և 525,5՝ ըստ գենոմի հետազոտության, հետերոզիգոտությունը մոտ 03%) է:BUSCO-ի գնահատված միավորը կազմել է 93,9%:Համեմատելով «Old blush»-ի (haploOB) հետ՝ այս գենոմի որակն ու ամբողջականությունը հաստատվել է բազային մեկ հիմքի ճշգրտությամբ և LTR հավաքման ինդեքսով (LAI=20.03):R.wichuraiana գենոմը պարունակում է 32674 սպիտակուցային կոդավորման գեն:

2. Multi-omics համատեղ վերլուծությունը, որը բաղկացած է համեմատական ​​գենոմիկայից, տրանսկրիպտոմիկայից, գենետիկ պոպուլյացիայի QTL վերլուծությունից, բացահայտեց R. wichuraiana-ի և Rosa chinensis-ի միջև կարևոր տեսակավորումը:Բացի այդ, QTL-ում հարակից գեների արտահայտման տատանումները հավանաբար կապված են ցողունի ցողունի ձևավորման հետ:

Basye;s Thornless-ի և Rosa chinensis-ի համեմատական ​​գենոմիկայի վերլուծությունը, ներառյալ սինթենի անալիզը, գենային ընտանիքի կլաստերը, ընդարձակման և կծկման վերլուծությունը, բացահայտեց մեծ թվով տատանումներ, որոնք կապված էին վարդերի կարևոր հատկությունների հետ:NAC-ի և FAR1/FRS գեների ընտանիքում եզակի ընդլայնումը, հավանաբար, կապված է սև կետի նկատմամբ դիմադրության հետ:

Zhong, M., et al.«Վարդ առանց փշոտ. գենոմային պատկերացումներ՝ կապված խոնավության հարմարվողականության հետ»National Science Review, 2021;, nwab092.