A Heatmap fiókot hőtérkép rajzolására használják, amely képes szűrni, normalizálni és klasztermátrix adatokat. Leginkább a különböző minták közötti génexpressziós szint klaszteranalízisére használják.
Biológiai funkciók csatolása a FASTA fájl szekvenciáihoz a szekvenciák adatbázishoz igazításával, beleértve az NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam szekvenciákat.
A BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) egy algoritmus és program a hasonló biológiai szekvenciákkal rendelkező régiók megtalálására.Összehasonlítja ezeket a szekvenciákat szekvencia-adatbázisokkal, és kiszámítja a statisztikai szignifikanciát.A BLAST négyféle eszközből áll a szekvencia típusa alapján: blastn, lastp, blastx és tblastn.