Termékek

Egymagvú RNS szekvenálás

Az egysejt-rögzítés és az egyedi könyvtár-építési technika fejlődése a nagy áteresztőképességű szekvenálással kombinálva lehetővé teszi a génexpressziós vizsgálatokat sejtenként.Lehetővé teszi a komplex sejtpopulációk mélyebb és teljesebb rendszerelemzését, amelyben nagyrészt elkerüli heterogenitásuk elfedését az összes sejt átlagának felvételével.

Egyes sejtek azonban nem alkalmasak egysejt-szuszpenzió készítésére, ezért más minta-előkészítési módszerek – a szövetekből a sejtmag kivonása – szükségesek, vagyis a sejtmagot közvetlenül a szövetekből vagy sejtekből vonják ki, és egymagos szuszpenziót készítenek egy- sejt szekvenálás.

A BMK 10× Genomics ChromiumTM alapú egysejtű RNS szekvenáló szolgáltatást nyújt.Ezt a szolgáltatást széles körben használták olyan betegségekkel kapcsolatos vizsgálatokban, mint például az immunsejtek differenciálódása, a tumor heterogenitása, a szövetek fejlődése stb.

Térbeli transzkriptom chip: 10× Genomics

Platform: Illumina NovaSeq Platform

Lépjen kapcsolatba velünk

Szolgáltatás részletei

Bioinformatika

Demo eredmények

Technikai elv

A magok izolálását a 10× Genomics ChromiumTM biztosítja, amely nyolccsatornás mikrofluidikai rendszerből áll, kettős keresztezésekkel.Ebben a rendszerben egy vonalkóddal és primerrel, enzimekkel és egyetlen maggal ellátott gélgyöngyöket nanoliteres olajcseppbe kapszuláznak, és így Gel Bead-in-Emulsion (GEM) jön létre.A GEM kialakulása után minden GEM-ben megtörténik a sejtlízis és a vonalkódok felszabadítása.Az mRNS-t 10-szeres vonalkóddal és UMI-val ellátott cDNS-molekulákká reverzi átírják, amelyekre a továbbiakban szabványos szekvenálókönyvtár-építés vonatkozik.

A szövet nem alkalmas egysejt-szuszpenzió készítésére

Sejt/szövet	Ok
Friss fagyasztott szövet	Nem lehet friss vagy régóta mentett szervezeteket szerezni
Izomsejt, Megakariocita, Zsír…	A cella átmérője túl nagy ahhoz, hogy belépjen a műszerbe
Máj…	Túl törékeny a töréshez, nem képes megkülönböztetni az egyes sejteket
Neuronsejt, agy…	Érzékenyebb, könnyen stresszelhető, megváltoztatja a szekvenálási eredményeket
Hasnyálmirigy, pajzsmirigy…	Endogén enzimekben gazdag, befolyásolja az egysejt-szuszpenzió termelését

Egymagos vs egysejtű

Egymagvú	Egyetlen cella
Korlátlan cellaátmérő	Sejtátmérő: 10-40 μm
Az anyag lehet fagyasztott szövet	Az anyagnak friss szövetnek kell lennie
A fagyott sejtek alacsony stressze	Az enzimkezelés sejtstressz reakciót válthat ki
Nem kell eltávolítani a vörösvértesteket	A vörösvértesteket el kell távolítani
A nukleáris bioinformációt fejez ki	Az egész sejt bioinformációt fejez ki