-
Egymagvú RNS szekvenálás
Az egysejt-rögzítés és az egyedi könyvtár-építési technika fejlődése a nagy áteresztőképességű szekvenálással kombinálva lehetővé teszi a génexpressziós vizsgálatokat sejtenként.Lehetővé teszi a komplex sejtpopulációk mélyebb és teljesebb rendszerelemzését, amelyben nagyrészt elkerüli heterogenitásuk elfedését az összes sejt átlagának felvételével.
Egyes sejtek azonban nem alkalmasak egysejt-szuszpenzió készítésére, ezért más minta-előkészítési módszerek – a szövetekből a sejtmag kivonása – szükségesek, vagyis a sejtmagot közvetlenül a szövetekből vagy sejtekből vonják ki, és egymagos szuszpenziót készítenek egy- sejt szekvenálás.
A BMK 10× Genomics ChromiumTM alapú egysejtű RNS szekvenáló szolgáltatást nyújt.Ezt a szolgáltatást széles körben használták olyan betegségekkel kapcsolatos vizsgálatokban, mint például az immunsejtek differenciálódása, a tumor heterogenitása, a szövetek fejlődése stb.
Térbeli transzkriptom chip: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
BMKMANU S1000 térbeli átírás
A térbeli transzkriptomika a tudományos innováció élvonalában áll, lehetővé téve a kutatók számára, hogy a szöveteken belüli bonyolult génexpressziós mintákba mélyedjenek, miközben megőrzik azok térbeli kontextusát.A BMKGene különféle platformok közepette kifejlesztette a BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chipet, amelyfokozott felbontás5 µM, eléri a szubcelluláris tartományt, és lehetővé teszitöbbszintű felbontás beállításai.A hozzávetőleg 2 millió folttal rendelkező S1000 chip mikrolyukakat alkalmaz, amelyek térben vonalkódolt rögzítő szondákkal töltött gyöngyökkel vannak rétegezve.Az S1000 chipből térbeli vonalkódokkal dúsított cDNS-könyvtárat készítenek, majd az Illumina NovaSeq platformon szekvenálják.A térben vonalkódolt minták és UMI-k kombinációja biztosítja a generált adatok pontosságát és specifikusságát.A BMKManu S1000 chip egyedülálló tulajdonsága a sokoldalúságban rejlik, többszintű felbontási beállításokat kínál, amelyek finoman hangolhatók a különböző szövetekhez és részletszintekhez.Ez az alkalmazkodóképesség a chipet kiemelkedő választássá teszi a különféle térbeli transzkriptomikai vizsgálatokhoz, precíz térbeli klaszterezést biztosítva minimális zajjal.
A BMKManu S1000 chip és más térbeli transzkriptomikai technológiák segítségével a kutatók jobban megérthetik a sejtek térbeli szerveződését és a szövetekben előforduló összetett molekuláris kölcsönhatásokat, így felbecsülhetetlen értékű betekintést nyerhetnek a biológiai folyamatok mögött meghúzódó mechanizmusokba számos területen, így pl. onkológia, idegtudomány, fejlődésbiológia, immunológia és botanikai tanulmányok.
Platform: BMKManu S1000 chip és Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
A térbeli transzkriptomika egy élvonalbeli technológia, amely lehetővé teszi a kutatók számára, hogy a szöveteken belüli génexpressziós mintázatokat vizsgálják, miközben megőrzik térbeli kontextusukat.Ebben a tartományban az egyik hatékony platform a 10x Genomics Visium Illumina szekvenálással párosulva.A 10X Visium elve egy speciális chipen rejlik, amely egy kijelölt rögzítési területtel rendelkezik, ahová a szövetmetszetek kerülnek.Ez a rögzítési terület vonalkódos foltokat tartalmaz, amelyek mindegyike a szöveten belüli egyedi térbeli helynek felel meg.A szövetből befogott RNS-molekulákat ezután egyedi molekuláris azonosítókkal (UMI-k) jelölik a reverz transzkripciós folyamat során.Ezek a vonalkódos foltok és UMI-k lehetővé teszik a génexpresszió pontos térbeli feltérképezését és mennyiségi meghatározását egysejt felbontásban.A térben vonalkódolt minták és UMI-k kombinációja biztosítja a generált adatok pontosságát és specifikusságát.A Spatial Transcriptomics technológia használatával a kutatók mélyebben megérthetik a sejtek térbeli szerveződését és a szövetekben végbemenő összetett molekuláris kölcsönhatásokat, felbecsülhetetlen értékű betekintést nyújtva a biológiai folyamatok mögött meghúzódó mechanizmusokba számos területen, beleértve az onkológiát, idegtudományt, fejlődésbiológiát, immunológiát. és botanikai tanulmányok.
Platform: 10X Genomics Visium és Illumina NovaSeq
