-
BSA
A tömeges szegregáns elemzési platform egylépéses standard elemzésből és fejlett elemzésből áll, testreszabott paraméterbeállítással.A BSA egy olyan technika, amelyet a fenotípushoz kapcsolódó genetikai markerek gyors azonosítására alkalmaznak.A BSA fő munkafolyamata a következőket tartalmazza: 1. két rendkívül ellentétes fenotípusú egyedcsoport kiválasztása;2. az összes egyed DNS-ének, RNS-ének vagy SLAF-szekvenciájának (Developed by Biomarker) egyesítése a DNS két tömegének kialakítására;3. differenciális szekvenciák azonosítása a referencia genommal szemben vagy azok között, 4. a jelölt kapcsolt régiók előrejelzése ED és SNP-index algoritmussal;5. Funkcionális analízis és géndúsítás a jelölt régiókban stb. Az adatok fejlettebb bányászata, beleértve a genetikai marker szűrést és a primer tervezést is.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Az Amplicon (16S/18S/ITS) platform a mikrobiális diverzitás projektelemzésben szerzett több éves tapasztalattal készült, amely szabványos alapelemzést és személyre szabott elemzést tartalmaz: az alapelemzés lefedi a jelenlegi mikrobiális kutatások főbb elemzési tartalmát, az elemzési tartalom gazdag és átfogó, és az elemzési eredményeket projektjelentések formájában mutatják be;A személyre szabott elemzés tartalma sokrétű.A minták kiválaszthatók és a paraméterek rugalmasan beállíthatók az alapelemzési jelentésnek és a kutatási célnak megfelelően, a személyre szabott igények megvalósításához.Windows operációs rendszer, egyszerű és gyors.
-
Evolúciós genetika
Az evolúciós genetika egy csomagolt szekvenálási szolgáltatás, amelyet arra terveztek, hogy átfogó értelmezést biztosítson adott anyagok evolúciós információiról genetikai variációk alapján, beleértve az SNP-ket, az InDeleket, az SV-ket és a CNV-ket.Minden alapvető elemzést megad, amely a populációk evolúciós változásainak és genetikai jellemzőinek leírásához szükséges, mint például a populáció szerkezete, genetikai diverzitása, filogenetikai viszonyok, stb. Tartalmaz továbbá génáramlási vizsgálatokat is, amelyek lehetővé teszik a populáció effektív méretének, divergenciájának becslését.
-
Összehasonlító genomika
Az összehasonlító genomika szó szerint a különböző fajok teljes genomszekvenciájának és szerkezetének összehasonlítását jelenti.Ennek a tudományágnak a célja a fajok evolúciójának, génfunkcióinak, génszabályozó mechanizmusainak genomszintű feltárása azáltal, hogy azonosítja a szekvenciastruktúrákat és -elemeket, amelyek konzerváltak vagy differenciálódtak a különböző fajok között.A tipikus összehasonlító genomikai vizsgálat magában foglalja a géncsalád elemzését, az evolúciós fejlődést, a teljes genom duplikációját, a szelektív nyomást stb.
-
Evolúciós genetika
A populációs és evolúciós genetikai elemzési platform a BMK K+F csapatában évek óta felhalmozott hatalmas tapasztalat alapján jött létre.Ez egy felhasználóbarát eszköz, különösen azoknak a kutatóknak, akik nem bioinformatikusok.Ez a platform lehetővé teszi az alapvető evolúciós genetikával kapcsolatos alapelemzést, beleértve a filogenetikai faépítést, a kapcsolati egyensúlyhiány elemzését, a genetikai diverzitás felmérését, a szelektív sweep elemzést, a rokonsági elemzést, a PCA-t, a populációszerkezet elemzését stb.
-
Hi-C alapú Genome Assembly
A Hi-C egy olyan módszer, amelyet a kromoszómakonfiguráció rögzítésére terveztek a közelségen alapuló kölcsönhatások és a nagy áteresztőképességű szekvenálás kombinálásával.Úgy gondolják, hogy ezen kölcsönhatások intenzitása negatívan korrelál a kromoszómák fizikai távolságával.Ezért a Hi-C adatok irányíthatják az összeállított szekvenciák csoportosítását, rendezését és orientációját egy genomvázlatban, és rögzíthetik azokat bizonyos számú kromoszómához.Ez a technológia lehetővé teszi a kromoszóma szintű genom összeállítást populáció alapú genetikai térkép hiányában.Minden egyes genomnak szüksége van egy Hi-C-re.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Növényi/állati de Novo genom szekvenálás
De NovoA szekvenálás egy faj teljes genomjának felépítését jelenti szekvenálási technológiák, például PacBio, Nanopore, NGS stb. segítségével, referenciagenom hiányában.A harmadik generációs szekvenálási technológiák olvasási hosszának jelentős javulása új lehetőségeket hozott az összetett genomok összeállításában, mint például a nagy heterozigótasággal, az ismétlődő régiók magas arányával, poliploidokkal stb. ismétlődő elemek, abnormális GC-tartalmú régiók és más rendkívül összetett régiók feloldása.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
Emberi egész exome szekvenálás
A teljes exome szekvenálás (WES) költséghatékony szekvenálási stratégiának tekinthető a betegséget okozó mutációk azonosítására.Bár az exonok a teljes genomnak csak körülbelül 1,7%-át foglalják el, közvetlenül a teljes fehérjefunkciók profilját képviselik.Az emberi genomban beszámoltak arról, hogy a betegséggel összefüggő mutációk több mint 85%-a fehérjét kódoló régióban fordul elő.
A BMKGENE átfogó és rugalmas emberi teljes exome szekvenálási szolgáltatásokat kínál különböző exonrögzítési stratégiákkal a különböző kutatási célok eléréséhez.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
A nagy áteresztőképességű genotipizálás, különösen nagyszámú populáción, a genetikai asszociációs vizsgálatok alapvető lépése, amely genetikai alapot biztosít a funkcionális génfelfedezéshez, az evolúciós elemzéshez stb. A teljes genom mélyreható újraszekvenálása helyett redukált reprezentációs genomszekvenálás (RRGS) ).Ezt általában úgy érik el, hogy a restrikciós fragmenst egy adott mérettartományon belül extrahálják, amelyet csökkentett reprezentációs könyvtárnak (RRL) neveznek.A specifikus lókusz amplifikált fragmens szekvenálás (SLAF-Seq) egy saját fejlesztésű stratégia az SNP genotipizálásához referencia genommal vagy anélkül.
Platform: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina és BGI
A Sequencing by Synthesis (SBS) technológián alapuló Illumina szekvenálási technológia egy globálisan elfogadott NGS innováció, amely a világ szekvenálási adatainak több mint 90%-áért felelős.Az SBS elve magában foglalja a fluoreszcensen jelölt reverzibilis terminátorok leképezését, amikor minden dNTP-t hozzáadunk, majd ezt követően hasítjuk, hogy lehetővé tegyük a következő bázis beépülését.Mivel mindegyik szekvenálási ciklusban mind a négy reverzibilis terminátorhoz kötött dNTP jelen van, a természetes versengés minimalizálja a beépülési torzítást.Ez a sokoldalú technológia támogatja az egyszeri olvasási és a páros végű könyvtárakat is, és számos genomikai alkalmazást kielégít.Az Illumina szekvenálás nagy áteresztőképességű képességei és precizitása a genomikai kutatás sarokkövévé pozícionálja, lehetővé téve a tudósok számára, hogy páratlan részletességgel és hatékonysággal fejtsék ki a genomok bonyolultságát.
A BGI által kifejlesztett DNBSEQ egy másik innovatív NGS-technológia, amelynek sikerült tovább csökkentenie a szekvenálás költségeit és növelni az áteresztőképességet.A DNBSEQ-könyvtárak elkészítése magában foglalja a DNS-fragmentációt, az ssDNS-előkészítést és a gördülő kör amplifikációját, hogy megkapjuk a DNS-nanogolyókat (DNB).Ezeket ezután szilárd felületre töltjük, majd kombinatorikus szonda-horgony szintézissel (cPAS) szekvenálják.
Előre elkészített könyvtári szekvenáló szolgáltatásunk lehetővé teszi ügyfeleink számára, hogy különféle forrásokból (többek között mRNS, teljes genom, amplikon) készítsék el szekvenáló könyvtáraikat.Ezt követően ezeket a könyvtárakat el lehet szállítani szekvenálási központjainkba minőség-ellenőrzés és szekvenálás céljából Illumina vagy BGI platformokon.
