-
Metagenomikus szekvenálás -NGS
A metagenom egy vegyes organizmusközösség teljes genetikai anyagának gyűjteményére utal, mint például a környezeti metagenom, az emberi metagenom stb. Mind tenyészthető, mind nem tenyészthető mikroorganizmusok genomjait tartalmazza.A metagenomikus szekvenálás a környezeti mintákból kinyert vegyes genomiális anyagok elemzésére szolgáló molekuláris eszköz, amely részletes információkat nyújt a fajok diverzitásáról és abundanciájáról, a populáció szerkezetéről, a filogenetikai rokonságról, a funkcionális génekről és a környezeti tényezőkkel való korrelációs hálózatról.
Felület:Illumina NovaSeq platform
-
Metagenomikus szekvenálás-nanopórus
A Metagenomics a környezeti mintákból kinyert vegyes genomi anyagok elemzésére használt molekuláris eszköz, amely részletes információkat nyújt a fajok sokféleségéről és abundanciájáról, a populáció szerkezetéről, a filogenetikai kapcsolatról, a funkcionális génekről és a környezeti tényezőkkel való korrelációs hálózatról stb. metagenomikai vizsgálatokhoz.Az olvasási hosszban nyújtott kiemelkedő teljesítménye nagymértékben javította a lefelé irányuló metagenomikai elemzést, különösen a metagenom összeállítást.Az olvasási hossz előnyeit kihasználva a Nanopore alapú metagenomikai vizsgálat folyamatosabb összeszerelést tesz lehetővé, mint a sörétes metagenomikával.Kiadták, hogy a nanopórus alapú metagenomika sikeresen generált teljes és zárt bakteriális genomokat mikrobiomokból (Moss, EL, et. al,Természet Biotech, 2020)
Felület:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
A 16S és 18S rRNS-en lévő, erősen konzervált és hipervariábilis régiókat egyaránt tartalmazó alegység tökéletes molekuláris ujjlenyomat a prokarióta és eukarióta szervezetek azonosításához.A szekvenálás előnyeit kihasználva ezek az amplikonok megcélozhatók a konzervált részek alapján, és a hipervariábilis régiók teljes mértékben jellemezhetők a mikrobiális azonosításhoz, hozzájárulva a mikrobiális diverzitás-analízis, taxonómia, filogenetika stb. vizsgálatához. Egymolekula valós idejű (SMRT) ) a PacBio platform szekvenálása rendkívül pontos hosszú leolvasásokat tesz lehetővé, amelyek lefedhetik a teljes hosszúságú amplikonokat (kb. 1,5 Kb).A genetikai mező szélesebb látásmódja nagymértékben javította a fajok annotációjának felbontását a baktériumok vagy gombák közösségében.
Felület:PacBio folytatása II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A 16S/18S/ITS amplikon szekvenálás célja, hogy feltárja a törzsfejlődést, a taxonómiát és a fajbőséget egy mikrobiális közösségben a háztartási genetikai markerek PCR-termékeinek vizsgálatával, amelyek mind erősen konverziós, mind hipervariábilis részeket tartalmaznak.A tökéletes molekuláris ujjlenyomatok Woeses és munkatársai (1977) általi bevezetése lehetővé teszi az izolációmentes mikrobióm-profilalkotást.A 16S (baktériumok), 18S (gombák) és a belső átírt spacer (ITS, gombák) szekvenálása lehetővé teszi mind a bőséges, mind a ritka és azonosítatlan fajok azonosítását.Ez a technológia széles körben alkalmazott és fő eszközzé vált a különböző környezetekben, például emberi szájban, belekben, székletben stb.
Felület:Illumina NovaSeq platform
-
Bakteriális és gombás teljes genom újraszekvenálása
A bakteriális és gombás teljes genom újraszekvenálása kritikus eszköz az ismert baktériumok és gombák genomjának kiegészítéséhez, valamint több genom összehasonlításához vagy új szervezetek genomjainak feltérképezéséhez.Nagyon fontos a baktériumok és gombák teljes genomjának szekvenálása a pontos referenciagenomok létrehozása, a mikrobiális azonosítás és egyéb összehasonlító genom vizsgálatok elvégzése érdekében.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Metatranszkriptom szekvenálás
A metatranszkriptom szekvenálás azonosítja a mikrobák (eukarióták és prokarióták) génexpresszióját természetes környezetben (pl. talajban, vízben, tengerben, ürülékben és bélben). Pontosabban, ez a szolgáltatás lehetővé teszi komplex mikrobiális közösségek teljes génexpressziós profiljának megszerzését, taxonómiai elemzést. fajok, eltérően expresszált gének funkcionális dúsítási elemzése és így tovább.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Gombás genom
A Biomarker Technologies a konkrét kutatási céltól függően biztosítja a gombák genomfelmérését, finom genomját és pene-teljes genomját.A genom szekvenálása, összeállítása és funkcionális annotációja a következő generációs szekvenálás + harmadik generációs szekvenálás kombinálásával érhető el a magas szintű genom összeállítás érdekében.A Hi-C technológia a genom kromoszóma szintű összeállításának megkönnyítésére is használható.
Felület:PacBio folytatása II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq platform
-
A baktériumok teljes genomja
A Biomarker Technologies szekvenálási szolgáltatást nyújt a baktériumok teljes genomjának felépítéséhez nulla résekkel.A baktériumok teljes genomépítésének fő munkafolyamata magában foglalja a harmadik generációs szekvenálást, összeállítást, funkcionális annotációt és fejlett bioinformatikai elemzést, amelyek megfelelnek a meghatározott kutatási céloknak.A baktériumok genomjának átfogóbb profilalkotása lehetővé teszi a biológiai folyamataik mögött meghúzódó alapvető mechanizmusok feltárását, amelyek szintén értékes referenciaként szolgálhatnak a magasabb rendű eukarióta fajok genomikai kutatásaihoz.
Felület:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq platform
PacBio folytatása II
