-
PacBio-teljes hosszúságú 16S/18S/ITS amplikon szekvenálás
Az Amplicon (16S/18S/ITS) platform a mikrobiális diverzitás projektelemzésben szerzett több éves tapasztalattal készült, amely szabványos alapelemzést és személyre szabott elemzést tartalmaz: az alapelemzés lefedi a jelenlegi mikrobiális kutatások főbb elemzési tartalmát, az elemzési tartalom gazdag és átfogó, és az elemzési eredményeket projektjelentések formájában mutatják be;A személyre szabott elemzés tartalma sokrétű.A minták kiválaszthatók és a paraméterek rugalmasan beállíthatók az alapelemzési jelentésnek és a kutatási célnak megfelelően, a személyre szabott igények megvalósításához.Windows operációs rendszer, egyszerű és gyors.
-
PacBio-teljes hosszúságú transzkriptum (nem referencia)
A Pacific Biosciences (PacBio) Isoform szekvenálási adatait bemenetként figyelembe véve ez az alkalmazás képes azonosítani a teljes hosszúságú átirat szekvenciákat (összeszerelés nélkül).A teljes hosszúságú szekvenciák referencia genommal való feltérképezésével a transzkriptumok ismert gének, transzkriptumok, kódoló régiók stb. segítségével optimalizálhatók. Ebben az esetben az mRNS-struktúrák pontosabb azonosítása érhető el, például alternatív splicing stb.Az NGS transzkripciós szekvenálási adatokkal végzett közös elemzés átfogóbb annotációt és pontosabb kvantifikációt tesz lehetővé az expresszió transzkriptum szintjén, ami nagymértékben előnyös a downstream differenciális expressziós és funkcionális elemzésben.
-
Eszközkészletek
A BMKCloud egy vezető bioinformatikai platform, amely egyablakos megoldást kínál a genomikai programokhoz, amelyben széles körben megbíznak a kutatók számos területen, beleértve az orvosi, mezőgazdasági, környezetvédelmi stb. területeket. A BMKCloud elkötelezett amellett, hogy integrált, megbízható és hatékony szolgáltatásokat nyújtson, beleértve a bioinformatikai elemzési platformokat és eszközöket. , számítási erőforrások, nyilvános adatbázis, bioinformatikai online tanfolyamok stb. A BMKCloud számos gyakran használt bioinformatikai eszközzel rendelkezik, beleértve a génannotációt, evolúciós genetikai eszközöket, ncRNS-t, adatminőség-ellenőrzést, összeállítást, igazítást, adatkinyerést, mutációkat, statisztikákat, ábragenerátort, szekvencia elemzés, stb.
-
kis RNS
A kis RNS-ek rövid, nem kódoló RNS-ek, átlagosan 18-30 nt hosszúságúak, beleértve a miRNS-t, az siRNS-t és a piRNS-t.Ezekről a kis RNS-ekről számoltak be arról, hogy tömegesen részt vesznek különböző biológiai folyamatokban, mint például az mRNS lebontásában, a transzláció gátlásában, a heterokromatin képződésében stb. A kis RNS szekvenálási analízist széles körben alkalmazták állati/növényi fejlődéssel, betegséggel, vírussal stb. kapcsolatos vizsgálatokban. Kis RNS A szekvenálás-elemző platform standard elemzésből és fejlett adatbányászatból áll.Az RNS-seq adatok alapján standard elemzéssel miRNS azonosítás és előrejelzés, miRNS célgén előrejelzés, annotáció és expressziós elemzés érhető el.A fejlett elemzés lehetővé teszi a személyre szabott miRNS-keresést és -kinyerést, a Venn-diagram generálását, a miRNS- és a célgénhálózat kiépítését.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Az NGS-WGS egy teljes genom újraszekvenálási elemző platform, amelyet a Biomarker Technologies terén szerzett gazdag tapasztalatok alapján fejlesztettek ki.Ez az egyszerűen használható platform lehetővé teszi az integrált elemzési munkafolyamat gyors benyújtását néhány alapvető paraméter beállításával, amelyek illeszkednek az Illumina platformról és a BGI szekvenáló platformról generált DNS-szekvenálási adatokhoz.Ezt a platformot nagy teljesítményű számítástechnikai szerveren telepítik, amely rendkívül hatékony adatelemzést tesz lehetővé nagyon korlátozott időn belül.A személyre szabott adatbányászat standard elemzés alapján érhető el, beleértve a mutált gén lekérdezést, a PCR primer tervezést stb.
-
mRNS (referencia)
A transzkriptom a kapcsolat a genomi genetikai információ és a biológiai funkció proteomja között.A transzkripciós szintű szabályozás az élőlények legfontosabb és legszélesebb körben vizsgált szabályozási módja.A transzkriptom szekvenálás bármely időpontban vagy bármilyen körülmények között meg tudja szekvenálni a transzkriptumot egyetlen nukleotid pontos felbontással. Dinamikusan tükrözheti a géntranszkripció szintjét, egyidejűleg azonosíthatja és mennyiségileg meghatározhatja a ritka és normál transzkriptumokat, és szerkezeti információkat szolgáltathat minta konkrét átirat.
Jelenleg a transzkriptom szekvenálási technológiát széles körben alkalmazzák az agronómiában, az orvostudományban és más kutatási területeken, beleértve az állatok és növények fejlődésének szabályozását, a környezeti alkalmazkodást, az immunkölcsönhatást, a gén lokalizációját, a fajok genetikai evolúcióját, valamint a daganatok és genetikai betegségek kimutatását.
-
Metagenomika (NGS)
Ezt az elemző platformot több éves tapasztalat alapján sörétes metagenomikai adatok elemzésére tervezték.Integrált munkafolyamatból áll, amely különféle általánosan szükséges metagenomikai elemzéseket tartalmaz, beleértve az adatfeldolgozást, a fajszintű vizsgálatokat, a génfunkció-szintű vizsgálatokat, a metagenom binninget stb. Ezen kívül testreszabott adatbányászati eszközök állnak rendelkezésre standard elemzési munkafolyamat során, beleértve a gén- és fajlekérdezést is. , paraméter beállítás, személyre szabott ábra generálás stb.
-
LncRNS
A hosszú, nem kódoló RNS-ek (lncRNS) olyan transzkriptumok, amelyek hossza meghaladja a 200 nt-t, és nem képesek fehérjéket kódolni.A felhalmozott bizonyítékok arra utalnak, hogy a legtöbb lncRNS nagy valószínűséggel működőképes.A nagy áteresztőképességű szekvenálási technológiák és a bioinformatikai elemző eszközök lehetővé teszik számunkra, hogy hatékonyabban tárjuk fel az lncRNS-szekvenciákat és pozícionáló információkat, és elvezetnek bennünket a kulcsfontosságú szabályozó funkciókkal rendelkező lncRNS-ek felfedezéséhez.A BMKCloud büszke arra, hogy ügyfeleink számára lncRNS szekvenálási elemző platformot biztosít a gyors, megbízható és rugalmas lncRNS elemzés eléréséhez.
-
GWAS
A genomszintű asszociációs vizsgálat (GWAS) célja olyan genetikai változatok (genotípus) azonosítása, amelyek specifikus tulajdonságokhoz (fenotípushoz) kapcsolódnak.A GWA vizsgálatok azt vizsgálják, hogy a genetikai markerek nagyszámú egyed teljes genomjában kereszteződnek, és populációs szintű statisztikai elemzéssel előrejelzik a genotípus-fenotípus asszociációkat.A teljes genom újraszekvenálása potenciálisan minden genetikai változatot felfedezhet.A fenotípusos adatokkal összekapcsolva a GWAS feldolgozható a fenotípushoz kapcsolódó SNP-k, QTL-ek és jelölt gének azonosítására, ami erősen támogatja a modern állat-/növénynemesítést.Az SLAF egy saját fejlesztésű egyszerűsített genomszekvenálási stratégia, amely genom-szerte elosztott markereket, SNP-t fedez fel.Ezek az SNP-k, mint molekuláris genetikai markerek, feldolgozhatók a célzott tulajdonságokkal rendelkező asszociációs vizsgálatokhoz.Költséghatékony stratégia az összetett tulajdonságokhoz kapcsolódó genetikai variációk azonosítására.
-
Nanopore Teljes hosszúságú transzkriptomika
Az organizmusok komplex és variábilis alternatív izoformái fontos genetikai mechanizmusok a génexpresszió és a fehérjediverzitás szabályozásában.A transzkriptum struktúrák pontos azonosítása az alapja a génexpressziós szabályozási minták mélyreható tanulmányozásának.A Nanopore szekvenáló platform sikeresen hozta a transzkriptomikus vizsgálatot izoforma-szintre.Ez az elemző platform a Nanopore platformon generált RNS-Seq adatok elemzésére szolgál referencia genom alapján, amely minőségi és kvantitatív elemzéseket tesz lehetővé génszinten és transzkriptum szinten egyaránt.
-
cirk-RNS
A cirkuláris RNS (circRNS) a nem kódoló RNS egy fajtája, amelyről a közelmúltban megállapították, hogy létfontosságú szerepet játszanak a fejlődésben, a környezeti ellenállásban stb. részt vevő szabályozó hálózatokban. Különbözik a lineáris RNS-molekuláktól, pl. A cirRNS végei összekapcsolódnak, és körkörös szerkezetet alkotnak, ami megóvja őket az exonukleáz emésztésétől, és stabilabb, mint a legtöbb lineáris RNS.A CircRNS-ről azt találták, hogy sokféle funkcióval rendelkezik a génexpresszió szabályozásában.A CircRNS ceRNS-ként működhet, amely kompetitíven köti a miRNS-t, amelyet miRNS-szivacsként ismernek.A CircRNA szekvenáló elemző platform lehetővé teszi a cirRNS szerkezet- és expressziós elemzését, a célpont előrejelzését és más típusú RNS-molekulákkal való együttes elemzést
-
BSA
A tömeges szegregáns elemzési platform egylépéses standard elemzésből és fejlett elemzésből áll, testreszabott paraméterbeállítással.A BSA egy olyan technika, amelyet a fenotípushoz kapcsolódó genetikai markerek gyors azonosítására alkalmaznak.A BSA fő munkafolyamata a következőket tartalmazza: 1. két rendkívül ellentétes fenotípusú egyedcsoport kiválasztása;2. az összes egyed DNS-ének, RNS-ének vagy SLAF-szekvenciájának (Developed by Biomarker) egyesítése a DNS két tömegének kialakítására;3. differenciális szekvenciák azonosítása a referencia genommal szemben vagy azok között, 4. a jelölt kapcsolt régiók előrejelzése ED és SNP-index algoritmussal;5. Funkcionális analízis és géndúsítás a jelölt régiókban stb. Az adatok fejlettebb bányászata, beleértve a genetikai marker szűrést és a primer tervezést is.
