MIKROBIÁLIS
Bakteriális kompatibilitás és immobilizáció a bioszénnel, javítja a tebukonazol lebomlását, a talaj mikrobiom összetételét és működését
Teljes hosszúságú 16S amplikon szekvenálás |PacBio HiFi |Alfa diverzitás |Béta változatosság
Ebben a tanulmányban a teljes hosszúságú 16S amplikon szekvenálást PacBio-val és a bioinformatikai elemzést a Biomarker Technologies biztosította.
Kiemelések
A bioszénnel immobilizált tebukonazolt lebontó baktériumot, az Alcaligenes faecalis WZ-2 biodegradációs hatékonyságát és a tebukonazollal szennyezett talajra gyakorolt hatását vizsgáltuk a szabadon lebontó WZ-2 törzshöz képest.
1. A bioszénnel immobilizált WZ-2 hatékonyabb lebomlást mutatott a tebukonazolban, mint a szabad WZ-2, mivel a tebukonazol felezési idejét a talajban 18,7 napról 13,3 napra csökkentette.
2. A bioszénnel immobilizált WZ-2 képes volt helyreállítani a natív talaj mikrobiális enzimaktivitását, beleértve az ureázt, dehidrogenázt és invertázt stb.
3. A bioszénnel immobilizált WZ-2-vel kezelt talaj mikrobiológiai profilja teljes hosszúságú 16S szekvenálással határozottan alátámasztotta, hogy ez a rendszer a tebukonazol szennyezettség alatti baktériumközösség szerkezetének javításával helyreállíthatja a talaj egészségét.
Kísérlet (sorrendhez kapcsolódó)
Csoportosítás: CK: Természetes talaj;T: Tebukonazollal töményített talaj;S: A tebukonazol szabad WZ-2 törzset tartalmazó talajt tartalmazott;BC: a tebukonazol bioszénnel rendelkező talajt tartalmazott;BCS: A tebukonazol WZ-2 bioszénnel immobilizált talajt tartalmazott.
Mintavétel: 16S rDNS primerekkel amplifikált teljes talaj-DNS extrakció
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) és 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),teljes hosszúságú 16S rDNS-t képvisel
Szekvenáló platform: PacBio RS II
Szekvenálási stratégia: CCS HIFI olvas
Adatelemzés:BMKCloudA bioinformatikai platform az aranyhalat kiváló genetikai modellrendszerré teszi a halak fiziológiájához és evolúciójához.
Eredmény
A talaj mikrobiális közösségének szerkezetét 16S rDNS szekvenálással határoztuk meg.Az OTU gazdagsági és alfa-diverzitási indexét, beleértve a Chao1-, Ace-, Shannon- és Simpson-indexeket, értékelték, hogy feltárják az egyes rendszerek fajdiverzitását.60 napos inkubáció után minden index hasonló tendenciát mutatott, azaz a tebukonazol csökkentheti a talaj fajgazdagságát és diverzitását.A WZ-2 törzs hozzáadásával azonban a talajbaktériumok közössége részben helyreállt, mind a gazdagság, mind a diverzitás tekintetében.Korlátozott különbség volt megfigyelhető a BC, BCS és CK között, ami azt jelzi, hogy a bioszén és a bioszénnel immobilizált WZ-2 hatékonyan helyreállíthatja a talaj biológiai egészségét.
Ebben a tanulmányban a súlyozatlan pár-csoport módszert aritmetikai átlaggal (UPGMA) alkalmaztuk a csoportok közötti béta-diverzitás kimutatására.Amint az a következő ábrán látható, a BC, BSC és CK hasonlóbb mikrobiális összetételt mutatott a T és S csoporthoz képest, ami tovább jelezte, hogy a bioszén bevezetése a tebukonazollal szennyezett talaj bioremediációjába nagymértékben megkönnyítheti a mikrobiális közösség helyreállítását a talajban.
Ábra.A bakteriális közösségek UPGMA klaszterezése törzsi szinten különböző kezelések mellett
Referencia
Sun, Tong és mtsai."A bakteriális kompatibilitás és a bioszénnel való immobilizálás javította a tebukonazol lebomlását, a talaj mikrobiom összetételét és működését."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Hírek és kiemelések célja a legújabb sikeres esetek megosztása a Biomarker Technologies vállalattal, megörökítve az új tudományos eredményeket, valamint a tanulmány során alkalmazott kiemelkedő technikákat.
Feladás időpontja: 2022-08-08