A BMKGENE térbeli transzkripciós szekvenálási szolgáltatásokat nyújtott a „STEEL lehetővé teszi a térbeli és időbeli transzkriptomikus adatok nagy felbontású lehatárolását” című tanulmányhoz, amely a Briefings in Bioinformatics című folyóiratban jelent meg.
Ez a tanulmány egy nem felügyelt és sokrétű, tanuláson alapuló algoritmust javasolt, a Spatial Transcriptome cEll typE clustering (STEEL), amely a térbeli transzkriptomból származó doméneket olyan gyöngyök klaszterezésével azonosítja, amelyek nagyon hasonló génexpressziós profilokat és közeli térbeli távolságot mutatnak gráfok formájában.
A STEEL átfogó értékelése a 10X Visium platform térbeli transzkriptomikai adatkészletein azt mutatja, hogy nemcsak nagy felbontást ér el az egéragy finom struktúráinak jellemzésére, hanem lehetővé teszi több, külön-külön elemzett szövetlemez nagyobb méretűvé történő integrálását is.
A térbeli transzkriptom technológiák fejlődésével módszerünk nagymértékben alkalmazható lesz a domén azonosításban és a génexpressziós atlasz rekonstrukciójában.
Kattintsonitthogy többet megtudjon erről a tanulmányról.
Feladás időpontja: 2023.10.20