Merüljön el a vad változatos kutatási fajok tanulmányozásában rejlő lehetőségekben, amelyet a BMKGENE ügyfeleitől származó kulcsfontosságú eset példáz.A közelmúltban a Plant Biotechnology Journal idei számában megjelent cikk „Kromoszóma-szintű Wild Hevea brasiliensis genom: A genomiálisan segített tenyésztés és az életfontosságú lókuszok feltárása a megnövekedett gumihozam érdekében” című cikk értékes referenciaként szolgál.
A brazil gumifa (Hevea brasiliensis) a természetes gumi kulcsfontosságú forrása.A múlt század során a hagyományos tenyésztési módszerek figyelemreméltó hatszoros növekedést idéztek elő a gumigyártásban.A potenciális gumihozam-növekedésért felelős genetikai alapkőzet azonban továbbra is rejtélyes.
Ez a tanulmány a vad gumifa kromoszóma-szintű genomjának megalkotásába kezdett, a Nanopore hosszú leolvasású szekvenálás, az Illumina NGS szekvenálás és a Hi-C technológia szinergiáját alkalmazva.
Ezzel párhuzamosan 147 csíraplazma erőforrásból álló tárházat állítottak össze, amely nagy hozamú variációkat, vad törzseket és rokon fajokat tartalmazott az átfogó teljes genom reszekvenáláshoz (WGS) az Illumina platform segítségével.Az ezt követő szekvenálási adatokat szigorú populációgenetikai elemzésnek vetették alá, lehetővé téve a populáció szerkezetének, diverzitásának és kapcsolati egyensúlyhiányának boncolását.Ez az elemzés rávilágított a háziasítási eltérésekre a populációk között.
A további vizsgálatok kiterjedtek az Fst, π, Tajima D és LD elemzésére is, amelyek célja a megnövekedett latexhozamból származó szelekciós jelek feltárása volt, különös tekintettel a Wickham klónokra.
A Genome-wide Association Analysis (GWAS) csúcspontjaként meghatározták a hozamtulajdonságokhoz kapcsolódó markereket, majd a hozamhoz kapcsolódó géneket.A kezdeti validálás feltárta a két ERF gén különböző mutánsai közötti megkülönböztető transzkripciós aktivitásokat, amelyek előzetes bepillantást nyújtanak funkcionális jelentőségükbe.További megerősítést a soron következő kutatásokon belül terveznek.
A BMKGENE büszke arra, hogy hozzájárulhat ennek a tekintélyes populációnak a kiterjedt teljes genom újraszekvenálásához, valamint jelentős szerepet játszik a bioinformatikai elemzésben.Hatalmas tapasztalatunk magában foglalja az NGS/TGS szekvenálást és a multiomikus bioinformatikai elemzéseket több mint 1000 fajra kiterjedően.Bízunk benne, hogy a közelgő projektjei során együttműködhetünk Önnel.
Kattintson ide, hogytudjon meg többet erről a tanulmányról
Feladás időpontja: 2023. augusztus 29