● Nagy tapasztalattal rendelkező: Több mint 200 000 mintát dolgoztak fel a BMK-ban, amelyek különböző mintatípusokat tartalmaznak, beleértve a sejtkultúrát, szövetet, testfolyadékot stb., és több mint 7 000 mRNS-Seq projektet zártak le különböző kutatási területeken.
● Szigorú minőség-ellenőrzési rendszer: Az alapvető minőségellenőrzési pontok minden lépésében, beleértve a minta-előkészítést, a könyvtár-előkészítést, a szekvenálást és a bioinformatikát, szoros megfigyelés alatt állnak a kiváló minőségű eredmények elérése érdekében.
● Több adatbázis áll rendelkezésre a funkció annotációjához és a gazdagítási tanulmányokhoz a különböző kutatási célok elérése érdekében.
● Értékesítés utáni szolgáltatások: A projekt befejezését követően 3 hónapig érvényes értékesítés utáni szolgáltatások, beleértve a projektek nyomon követését, hibaelhárítását, az eredményekkel kapcsolatos kérdéseket és válaszokat stb.
Könyvtár | Szekvenálási stratégia | Ajánlott adatok | Minőség ellenőrzés |
Poly A dúsított | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidok:
Konc. (ng/μl) | Mennyiség (μg) | Tisztaság | Sértetlenség |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 A gélen korlátozott fehérje- vagy DNS-szennyeződés látható, vagy nincs. | Növényeknél: RIN≥6,5; Állatoknak: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; korlátozott vagy nincs alapvonali emelkedés |
Szövet: Súly (száraz):≥1 g
*5 mg-nál kisebb szövetek esetén gyorsfagyasztott (folyékony nitrogénben) szövetminta küldését javasoljuk.
Sejtszuszpenzió:Sejtszám = 3×106- 1×107
* Javasoljuk fagyasztott sejtlizátum szállítását.Abban az esetben, ha az adott cellaszám kisebb, mint 5×105.
Vérminták:Térfogat≥1 ml
Mikroorganizmus:Tömeg ≥ 1 g
Tartály: 2 ml-es centrifugacső (ón fólia nem ajánlott)
Mintacímkézés: Csoport+másolat pl. A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Szállítás:
Bioinformatika
eukarióta mRNS szekvenálás elemzési munkafolyamat
Bioinformatika
ØNyers adatok minőségének ellenőrzése
ØReferencia genom illesztés
ØÁtiratszerkezet-elemzés
ØKifejezés mennyiségi meghatározása
ØDifferenciális kifejezés elemzés
ØFunkció annotáció és gazdagítás
1.mRNS adatok Telítettségi görbe
2.Differenciális expressziós elemzés – Vulkán diagram
3.KEGG annotáció a DEG-eken
4.GO osztályozás a DEG-eken