BMKMANU S1000 térbeli átírás
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme
A BMKMANU S1000 előnyei
1) Szubcelluláris felbontás: Minden rögzítési terület több mint 2 millió térbeli vonalkódolt foltot tartalmazott, amelyek átmérője 2,5 µm, és a foltközpontok közötti távolság 5 µm, lehetővé téve a térbeli transzkriptom elemzést szubcelluláris felbontással (5 µm).
2) Többszintű felbontáselemzés: Rugalmas, többszintű elemzés 100 μm és 5 μm között a különböző szöveti jellemzők optimális felbontású feloldása érdekében.
3) Átfogó transzkriptom profilalkotás: A teljes szövetlemezről rögzített transzkriptumok elemezhetők a célgének számának és a célterületnek a korlátozása nélkül.
Szolgáltatási specifikációk
| Könyvtár | Szekvenálási stratégia | Adatkimenet ajánlott |
| S1000 cDNS könyvtár | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/minta |
Mintakövetelmények
| Minta | Szám | Méret | RNS minőség |
| OCT beágyazott szöveti blokk | 2-3 blokk/minta | kb.6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
A mintakészítési útmutatóval és a szervizmunkafolyamattal kapcsolatos további részletekért forduljon bizalommal aBMKGENE szakértő
Szerviz munkafolyamat
Kísérleti tervezés
Mintaszállítás
Előkísérlet
Térbeli vonalkódolás
Könyvtárépítés
Sorrendezés
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
A BMKMANU S1000 által generált adatok elemzése a BMKGENE által önállóan tervezett „BSTMatrix” szoftverrel történik, beleértve:
1) Génexpressziós mátrix generálása
2) HE képfeldolgozás
3) Kompatibilis a későbbi, harmadik féltől származó szoftverekkel az elemzéshez
4) Az online „BSTViewer” segít a vizualizációs eredmények elérésében különböző felbontásoknál.
1.Spot klaszterezés
2.Térbeli eloszlás
Nmegjegyzés: Felbontásszint=13 (100 µm, bal); 7 (50 µm, jobb)
3. Marker expressziós bőség klaszterezési hőtérkép
4.Minták közötti adatelemzés
