-
PacBio-Full-Length Transcriptome (nem referencia)
Az Amplicon (16S/18S/ITS) platform a mikrobiális diverzitás projektelemzés terén szerzett több éves tapasztalattal készült, amely szabványos alapelemzést és személyre szabott elemzést tartalmaz: az alapelemzés lefedi a jelenlegi mikrobiális kutatások főbb elemzési tartalmát, az elemzési tartalom gazdag és átfogó, és az elemzési eredményeket projektjelentések formájában mutatják be;A személyre szabott elemzés tartalma sokrétű.A minták kiválaszthatók és a paraméterek rugalmasan beállíthatók az alapelemzési jelentésnek és a kutatási célnak megfelelően, személyre szabott igények megvalósítása érdekében.Windows operációs rendszer, egyszerű és gyors.
-
PacBio-Full-Length Transcriptome (nem referencia)
A Pacific Biosciences (PacBio) Isoform szekvenálási adatait bemenetként figyelembe véve ez az alkalmazás képes azonosítani a teljes hosszúságú átirat szekvenciákat (összeállítás nélkül).A teljes hosszúságú szekvenciák referencia genomhoz való feltérképezésével a transzkriptumok ismert gének, transzkriptumok, kódoló régiók stb. segítségével optimalizálhatók. Ebben az esetben az mRNS-struktúrák pontosabb azonosítása érhető el, például alternatív splicing stb.Az NGS transzkripciós szekvenálási adatokkal végzett közös elemzés átfogóbb annotációt és pontosabb kvantifikációt tesz lehetővé az expresszió transzkriptum szintjén, ami nagymértékben előnyös a downstream differenciális expressziós és funkcionális elemzésben.
-
Eszközkészletek
A BMKCloud egy vezető bioinformatikai platform, amely egyablakos megoldást kínál a genomikai programokhoz, amelyben széles körben megbíznak a kutatók különböző területeken, beleértve az orvosi, mezőgazdasági, környezetvédelmi stb. , számítási erőforrások, nyilvános adatbázis, bioinformatikai online tanfolyamok stb. A BMKCloud számos gyakran használt bioinformatikai eszközzel rendelkezik, beleértve a génannotációt, evolúciós genetikai eszközöket, ncRNS-t, adatminőség-ellenőrzést, összeállítást, igazítást, adatkinyerést, mutációkat, statisztikákat, ábragenerátort, szekvencia elemzés, stb.
-
kis RNS
A kis RNS-ek rövid, nem kódoló RNS-ek, átlagosan 18-30 nt hosszúságúak, beleértve a miRNS-t, az siRNS-t és a piRNS-t.Ezekről a kis RNS-ekről a jelentések szerint tömegesen részt vesznek különböző biológiai folyamatokban, mint például az mRNS lebontásában, a transzláció gátlásában, a heterokromatin képződésében stb. A kis RNS szekvenálási analízist széles körben alkalmazták az állatok/növények fejlődésére, betegségekre, vírusokra stb. vonatkozó vizsgálatokban. Kis RNS A szekvenálás-elemző platform standard elemzésből és fejlett adatbányászatból áll.Az RNS-seq adatok alapján standard elemzéssel miRNS azonosítás és előrejelzés, miRNS célgén előrejelzés, annotáció és expressziós elemzés érhető el.A fejlett elemzés lehetővé teszi a személyre szabott miRNS-keresést és -kinyerést, a Venn-diagram generálását, a miRNS- és a célgénhálózat kiépítését.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Az NGS-WGS egy teljes genom újraszekvenálási elemző platform, amelyet a Biomarker Technologies terén szerzett gazdag tapasztalatok alapján fejlesztettek ki.Ez az egyszerűen használható platform lehetővé teszi az integrált elemzési munkafolyamat gyors benyújtását néhány alapvető paraméter beállításával, amelyek illeszkednek az Illumina platformról és a BGI szekvenáló platformról generált DNS szekvenálási adatokhoz.Ezt a platformot nagy teljesítményű számítástechnikai szerveren telepítik, amely rendkívül hatékony adatelemzést tesz lehetővé nagyon korlátozott időn belül.A személyre szabott adatbányászat standard elemzés alapján érhető el, beleértve a mutált gén lekérdezést, a PCR primer tervezést stb.
-
mRNS (referencia)
A transzkriptom a kapcsolat a genomi genetikai információ és a biológiai funkció proteomja között.A transzkripciós szintű szabályozás az élőlények legfontosabb és legszélesebb körben vizsgált szabályozási módja.A transzkriptom szekvenálás bármely időpontban vagy bármilyen körülmények között szekvenálhatja a transzkriptumot egyetlen nukleotid pontos felbontással. Dinamikusan tükrözheti a géntranszkripció szintjét, egyidejűleg azonosíthatja és számszerűsítheti a ritka és normál transzkriptumokat, és szerkezeti információkat szolgáltathat minta konkrét átirat.
Jelenleg a transzkriptom szekvenálási technológiát széles körben használják az agronómiában, az orvostudományban és más kutatási területeken, beleértve az állat- és növényfejlesztés szabályozását, a környezeti alkalmazkodást, az immunkölcsönhatást, a gén lokalizációját, a fajok genetikai evolúcióját, valamint a daganatok és a genetikai betegségek kimutatását.
-
Metagenomika (NGS)
Ezt az elemző platformot több éves tapasztalat alapján sörétes metagenomikai adatok elemzésére tervezték.Integrált munkafolyamatból áll, amely különféle általánosan szükséges metagenomikai elemzéseket tartalmaz, beleértve az adatfeldolgozást, a fajszintű vizsgálatokat, a génfunkció-szintű tanulmányokat, a metagenom binninget stb. Ezen kívül testreszabott adatbányászati eszközök állnak rendelkezésre standard elemzési munkafolyamat során, beleértve a gén- és fajlekérdezést is. , paraméter beállítás, személyre szabott ábra generálás stb.
-
LncRNS
A hosszú, nem kódoló RNS-ek (lncRNS) a 200 nt-nál hosszabb transzkriptumok egyik fajtája, amelyek nem képesek fehérjéket kódolni.A felhalmozott bizonyítékok arra utalnak, hogy a legtöbb lncRNS nagy valószínűséggel működőképes.A nagy áteresztőképességű szekvenálási technológiák és a bioinformatikai elemző eszközök lehetővé teszik számunkra, hogy hatékonyabban tárjuk fel az lncRNS-szekvenciákat és pozícionáló információkat, és elvezetnek bennünket a kulcsfontosságú szabályozó funkciókkal rendelkező lncRNS-ek felfedezéséhez.A BMKCloud büszke arra, hogy ügyfeleink számára lncRNS szekvenálási elemző platformot biztosít a gyors, megbízható és rugalmas lncRNS elemzés eléréséhez.
-
GWAS
A genomszintű asszociációs vizsgálat (GWAS) célja olyan genetikai változatok (genotípus) azonosítása, amelyek specifikus tulajdonságokhoz (fenotípushoz) kapcsolódnak.A GWA-vizsgálatok azt vizsgálják, hogy a genetikai markerek nagyszámú egyed teljes genomját keresztezik, és populációs szintű statisztikai elemzéssel előrejelzik a genotípus-fenotípus asszociációkat.A teljes genom újraszekvenálása potenciálisan minden genetikai változatot felfedezhet.A fenotípusos adatokkal összekapcsolva a GWAS feldolgozható a fenotípushoz kapcsolódó SNP-k, QTL-ek és jelölt gének azonosítására, ami erősen támogatja a modern állat-/növénynemesítést.Az SLAF egy saját fejlesztésű egyszerűsített genomszekvenálási stratégia, amely genom-szerte elosztott markereket, SNP-t fedez fel.Ezek az SNP-k, mint molekuláris genetikai markerek, feldolgozhatók a célzott tulajdonságokkal rendelkező asszociációs vizsgálatokhoz.Költséghatékony stratégia az összetett tulajdonságokhoz kapcsolódó genetikai variációk azonosítására.
-
Nanopore Teljes hosszúságú transzkriptomika
Az organizmusok komplex és variábilis alternatív izoformái fontos genetikai mechanizmusok a génexpresszió és a fehérjediverzitás szabályozásában.A transzkriptum struktúrák pontos azonosítása az alapja a génexpressziós szabályozási minták mélyreható tanulmányozásának.A Nanopore szekvenáló platform sikeresen hozta a transzkriptomikus vizsgálatot izoforma-szintre.Ez az elemző platform a Nanopore platformon generált RNA-Seq adatok elemzésére szolgál referencia genom alapján, amely minőségi és kvantitatív elemzéseket tesz lehetővé génszinten és transzkriptum szinten egyaránt.
