A baktériumok teljes genomja
Szolgáltatás előnyei
● Többféle szekvenálási stratégia áll rendelkezésre a különböző kutatási célokhoz
● A baktériumok teljes genomja 0 Gap garantált.
● Nagy tapasztalattal rendelkezik a baktériumok genomjának összeállításában, több mint 10 000 komplett genommal.
● Professzionális értékesítés utáni technikai támogatási csapat, amely konkrétabb kutatási igényeket teljesít.
Szolgáltatási specifikációk
| SorrendezésStratégia | Könyvtár | Garantált minőség | Becsült átfutási idő |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Gap | 30 nap |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Bioinformatikai elemzések
● Nyers adatok minőségének ellenőrzése
● Genom összeállítás
● Genomkomponens elemzés
● Génfüggvény annotáció
● Összehasonlító genomikai elemzés
Mintakövetelmények és szállítás
Mintakövetelmények:
MertDNS-kivonatok:
| Minta típusa | Összeg | Koncentráció | Tisztaság |
| DNS-kivonatok | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280 = 1,6-2,5 |
Szövetmintákhoz:
| Minta típusa | Javasolt mintakezelés | Mintatárolás és szállítás |
| Baktériumok | Figyelje meg a baktériumokat mikroszkóp alatt, és gyűjtse össze a baktériumokat exponenciális fázisukban Tegye át a baktériumtenyészetet (amely kb. 3-4,5e9 sejtet tartalmaz) egy 1,5 vagy 2 ml-es eppendorfba.(Maradj a jégen) Centrifugálja a csövet 1 percig 14000 g-vel, hogy összegyűjtse a baktériumokat, és óvatosan távolítsa el a felülúszót Zárja le a csövet, és fagyassza le a baktériumokat folyékony nitrogénben legalább 30 percig.Tárolja a csövet -80 ℃-os hűtőszekrényben. | Fagyassza le a mintákat folyékony nitrogénben 3-4 órára, és tárolja folyékony nitrogénben vagy -80 fokos hosszú távú foglalásig.Szárazjéggel történő mintaszállítás szükséges. |
Szerviz munkafolyamat
Mintaszállítás
Könyvtárépítés
Sorrendezés
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
1.Circos of bakteriális genom
2. Kódológén előrejelzés
3. Összehasonlító genomikai elemzés: filogenetikai fa
