Sekans transcriptom antye - Illumina
Karakteristik
● Doub bibliyotèk pou sekans transcriptom konplè a: deplètman rRNA ki te swiv pa preparasyon bibliyotèk PE150 ak seleksyon gwosè ki te swiv pa preparasyon bibliyotèk SE50.
● Ranpli analiz bioenfòmatik mRNA, lncRNA, circRNA ak miRNA nan rapò bioenfòmatik separe
● Analiz ansanm nan tout ekspresyon RNA nan rapò konbine, ki gen ladan analiz rezo ceRNA.
Avantaj sèvis yo
●Apwofondi analiz de rezo regilasyon: analiz rezo ceRNA pèmèt pa sekans jwenti mRNA, lncRNA, circRNA ak miRNA ak yon workflow bioenfòmatik konplè.
●Anotasyon konplè: nou itilize plizyè baz done pou anote Jèn Diferans Eksprime yo (DEGs) epi fè analiz anrichisman ki koresponn lan, bay enfòmasyon sou pwosesis selilè ak molekilè ki kache repons transcriptom la.
●Ekspètiz vaste: avèk yon dosye sou siksè fèmen plis pase 2000 pwojè transcriptome antye nan divès domèn rechèch, ekip nou an pote yon richès eksperyans nan chak pwojè.
●Kontwòl Kalite Rigour: nou aplike pwen kontwòl debaz yo atravè tout etap, soti nan preparasyon echantiyon ak bibliyotèk jiska sekans ak byoenfòmatik.Siveyans metikuleu sa a asire akouchman an nan rezilta yo toujou bon jan kalite.
● Anotasyon konplè: nou itilize plizyè baz done pou anote Jèn Diferans Eksprime yo (DEGs) epi fè analiz anrichisman ki koresponn lan, bay enfòmasyon sou pwosesis selilè ak molekilè ki kache repons transcriptom la.
●Sipò apre lavant: Angajman nou pwolonje pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis apre-sale 3 mwa.Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans depanaj, ak sesyon Q&A pou adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Egzanp kondisyon ak livrezon
| Bibliyotèk | Estrateji sekans | Done rekòmande | Kontwol kalite |
| rRNA apovri | Illumina PE150 | 16 Go | Q30≥85% |
| Gwosè chwazi | Illumina SE50 | 10-20M lekti |
Egzanp kondisyon:
Nukleotid:
| Konk. (ng/μl) | Kantite (μg) | Pite | Entegrite |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limite oswa pa gen okenn pwoteyin oswa kontaminasyon ADN yo montre sou jèl. | Plant: RIN≥6.5 Animal: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; limite oswa pa gen okenn elevasyon debaz |
Livrezon echantiyon rekòmande
Veso:
Tib santrifij 2 ml (pa rekòmande papye fèblan)
Egzanp etikèt: Gwoup + replike egzanp A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
chajman:
1.Dry-glas: Echantiyon yo bezwen chaje nan sache epi antere l nan glas sèk.
2.Tib RNAstable: echantiyon RNA yo ka cheche nan tib estabilizasyon RNA (egzanp RNAstable®) epi voye yo nan tanperati chanm.
Koule Travay Sèvis
Eksperyans konsepsyon
Livrezon echantiyon
RNA ekstraksyon
Konstriksyon bibliyotèk
Sekans
Analiz done
Sèvis apre-sale
Bioenfòmatik
Apèsi sou ekspresyon RNA
Jèn ki eksprime diferan
analiz ceRNA
MiRNA eksprime diferan ak RNA ki gen rapò
Eksplore pwogrè rechèch ki te fasilite pa sèvis sekans transcriptom antye BMKGene yo atravè yon koleksyon piblikasyon òganize.
Dai, Y. et al.(2022) 'Pwofil ekspresyon konplè nan mRNAs, lncRNAs ak miRNAs nan maladi Kashin-Beck idantifye pa RNA-sekans', Molecular Omics, 18 (2), pp 154-166.fè: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Full length transcriptomes analysis of cold-resistance of Apis cerana in Changbai Mountain during overwintering period.', Gene, 830, pp 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Multi-Omics Integration-Based Priyorite of Competiting Endogenous RNA Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characteristics and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Analiz entegre pwofil ekspresyon lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA revele nouvo apèsi sou mekanis potansyèl an repons a nematod rasin-ne nan pistach', BMC Genomics, 23(1), pp 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
Yan, Z. et al.(2022) 'Whole-transcriptome RNA sekans mete aksan sou mekanis molekilè ki asosye ak antretyen nan bon jan kalite apre rekòt nan bwokoli pa iradyasyon wouj ki ap dirije', Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
