Izolasyon nwayo reyalize pa 10 × Genomics ChromiumTM, ki gen ladan uit-chanèl sistèm mikrofluidik ak travèse doub.Nan sistèm sa a, yon pèl jèl ak kòd bar ak Jadendanfan, anzim ak yon nwayo sèl yo encapsulé nan gout lwil oliv ki menm gwosè ak nanolitè, jenere Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Yon fwa GEM yo fòme, liz selil ak lage kòd bar yo fèt nan chak GEM.mRNA yo ranvèse transkri nan molekil cDNA ak kòd bar 10 × ak UMI, ki pi lwen sijè a konstriksyon bibliyotèk sekans estanda.
Selil / Tisi | Rezon |
Unfresh tisi nan frizè | Pa kapab jwenn òganizasyon ki fre oswa ki sove lontan |
Selil nan misk, Megakaryocyte, Grès... | Dyamèt selil la twò gwo pou antre nan enstriman an |
Fwa… | Twò frajil kraze, pa kapab distenge selil sèl |
Selil newòn, sèvo... | Plis sansib, fasil estrès, pral chanje rezilta yo sekans |
Pankreyas, tiwoyid... | Rich nan anzim andojèn, ki afekte pwodiksyon an nan sispansyon sèl selil |
Single-nwayo | Selil sèl |
Dyamèt selil san limit | Dyamèt selilè: 10-40 μm |
Materyèl la ka jele tisi | Materyèl la dwe tisi fre |
Ba estrès nan selil jele | Tretman anzim ka lakòz reyaksyon estrès selilè |
Pa gen globil wouj yo bezwen retire | Selil wouj yo bezwen retire |
Nikleyè eksprime bioenfòmasyon | Selil la an antye eksprime bioenfòmasyon |
Bibliyotèk | Estrateji sekans | Done Volim | Egzanp kondisyon yo | Tisi |
10× Genomics bibliyotèk sèl-nwayo | 10x Genomics -Illumina PE150 | 100,000 lekti/selil approx.100-200 Gb | Nimewo selilè: > 2 × 105 selil konk.nan 700-1,200 selil / μL | ≥ 200 mg |
Pou plis detay sou gid preparasyon echantiyon ak workflow sèvis, tanpri ou lib pou pale ak yonEkspè BMKGENE
1.Spot clustering
2.Marker ekspresyon abondans clustering heatmap
3.Maker distribisyon jèn nan grap diferan
4.Cell trajectoire analiz/pseudotime