Sekans Bisulfit Redwi Reprezantasyon (RRBS)
Espesifikasyon Sèvis
Platfòm: NovaSeq platfòm, PE150
Kalite bibliyotèk: 200-400bp insert bibliyotèk ADN trete bisulfite
Estrateji sekans: Pè-Fen 150 bp
Rekòmande pwodiksyon done: 10 Gb done anvan tout koreksyon / echantiyon
Egzanp kondisyon yo
Kantite ADN: ≥ 2ug
Konsantrasyon ADN: ≥ 20ng/μl.
Pite: OD260/280 = 1.8 a 2.0 san degradasyon oswa kontaminasyon RNA
Analiz byoenfòmatik
Koule Travay Sèvis
Livrezon echantiyon
Konstriksyon bibliyotèk
Sekans
Analiz done
Sèvis apre-sale
a.Referans estatistik aliyman genòm
Estatistik nan kat lekti
Statistics nan pwofondè sekans ak pwoteksyon nan sit C
Akouvèti akimile
Defikasite ijesyon nan chak echantiyon
b.Deteksyon sit Methylation
Lis nivo metilation nan sit C
BS konvèsyon
Mcytosine etilate
Distribisyon nivo metilation
c.Methylation kat jeyografik
Genòm-lajè
Geleman enòm
d.Konparezon nivo metilation ant echantiyon yo
Pairwise Korelasyon CG metilasyon
PMethylation CA-CG
Cekla nan metilasyon CG
d.Diferans analiz methylation
SStatistik DMR
DMR distribisyon longè
Hmanje kat jeyografik
DDistribisyon MR nan rejyon vize
