-
Sekans RNA yon sèl-nwayo
Avansman nan kaptire selil sèl ak teknik konstriksyon bibliyotèk endividyèl konbine avèk sekans wo-debi pèmèt etid ekspresyon jèn sou baz selil pa selil.Li pèmèt yon analiz sistèm pi fon ak konplè sou popilasyon selil konplèks, kote li lajman evite maske eterojenite yo lè yo pran mwayèn nan tout selil yo.
Sepandan, kèk selil yo pa apwopriye pou yo fè nan sispansyon sèl-selil, kidonk lòt metòd preparasyon echantiyon - yo bezwen fè ekstraksyon nwayo soti nan tisi, se sa ki, nwayo yo ekstrè dirèkteman nan tisi oswa selil epi prepare nan sispansyon yon sèl-nwayo pou yon sèl-. sekans selilè.
BMK bay 10 × Genomics Chromium TM ki baze sou yon sèl selil RNA sèvis sekans.Sèvis sa a te lajman itilize nan etid sou etid ki gen rapò ak maladi, tankou diferansyasyon selil iminitè, eterojenite timè, devlopman tisi, elatriye.
Chip transcriptome espasyal: 10 × Genomics
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Plant/Animal Whole Genome Sekans
Tout genomic re-sekans, ke yo rele tou WGS, pèmèt revele nan tou de mitasyon komen ak ra sou genòm nan antye ki gen ladan Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Suppression Ensèsyon (InDel), Varyasyon Estrikti (SV), ak Varyasyon Nimewo Kopi (CNV). ).SV yo fòme yon pi gwo pòsyon nan baz varyasyon an pase SNP yo epi yo gen yon pi gwo enpak sou genòm nan, ki gen yon efè enpòtan sou òganis vivan yo.Resekans lekti long pèmèt pou idantifikasyon pi egzak nan fragman gwo ak varyasyon konplike paske lekti long fè li pi fasil travèse kwomozòm sou rejyon konplike tankou repete tandem, rejyon GC/AT ki rich, ak rejyon hyper-varyab.
Platfòm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Transcriptomics espasyal kanpe devan inovasyon syantifik, pèmèt chèchè yo fouye nan modèl ekspresyon jèn konplike nan tisi yo pandan y ap prezève kontèks espasyal yo.Nan mitan divès platfòm, BMKGene te devlope BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, ki gen yonrezolisyon amelyorenan 5µM, rive nan ranje subselilè, ak pèmètanviwònman rezolisyon milti-nivo.Chip S1000 a, ki gen apeprè 2 milyon tach, anplwaye mikwo-puits kouch ak pèl ki chaje ak sond kaptire spasyal barcode.Yon bibliyotèk cDNA, ki anrichi ak kòd bar espasyal, prepare nan chip S1000 la epi answit sekans sou platfòm Illumina NovaSeq la.Konbinezon an nan echantiyon espasyal barcoded ak UMIs asire presizyon ak espesifik nan done yo pwodwi yo.Atribi inik chip BMKManu S1000 a se nan adaptabilite li yo, ki ofri anviwònman rezolisyon milti-nivo ki ka tise byen branche sou diferan tisi ak nivo detay.Adaptabilite sa a pozisyon chip la kòm yon chwa eksepsyonèl pou divès etid transcriptomics espasyal, asire gwoup egzak espasyal ak bri minim.
Lè l sèvi avèk chip BMKManu S1000 ak lòt teknoloji transcriptomics espasyal, chèchè yo ka jwenn yon pi bon konpreyansyon sou òganizasyon espasyal selil yo ak entèraksyon molekilè konplèks ki fèt nan tisi yo, bay apèsi anpil valè sou mekanis ki kache pwosesis byolojik nan yon pakèt domèn, tankou nkoloji, nerosyans, byoloji devlopman, iminoloji ak etid botanik.
Platfòm: BMKManu S1000 chip ak Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transcriptomic espasyal se yon teknoloji dènye kri ki pèmèt chèchè yo mennen ankèt sou modèl ekspresyon jèn nan tisi yo pandan y ap prezève kontèks espasyal yo.Yon platfòm pwisan nan domèn sa a se 10x Genomics Visium makonnen ak sekans Illumina.Prensip 10X Visium la chita sou yon chip espesyalize ak yon zòn kaptire ki deziyen kote seksyon tisi yo mete.Zòn kaptire sa a gen tach ki gen kòd bar, chak korespondan ak yon kote espasyal inik nan tisi a.Lè sa a, molekil RNA yo te kaptire nan tisi a make ak idantifyan molekilè inik (UMI) pandan pwosesis transkripsyon ranvèse a.Tach kòd ak UMI sa yo pèmèt kat espasyal egzak ak quantifikasyon ekspresyon jèn nan yon rezolisyon sèl selil.Konbinezon an nan echantiyon espasyal barcoded ak UMIs asire presizyon ak espesifik nan done yo pwodwi yo.Lè yo itilize teknoloji Transcriptomics espasyal sa a, chèchè yo ka jwenn yon konpreyansyon pi pwofon sou òganizasyon espasyal selil yo ak entèraksyon molekilè konplèks ki fèt nan tisi yo, yo ofri apèsi anpil valè sou mekanis ki kache pwosesis byolojik yo nan plizyè domèn, tankou nkoloji, nerosyans, byoloji devlopman, iminoloji. , ak etid botanik.
Platfòm: 10X Genomics Visium ak Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sekans-Nanopore
Pandan ke sekans mRNA ki baze sou NGS sèvi kòm yon zouti versatile pou quantifikasyon ekspresyon jèn, depandans li sou lekti kout mete restriksyon sou efikasite li nan analiz transcriptomic konplèks.Nanopore sekans, nan lòt men an, anplwaye teknoloji ki long li, ki pèmèt sekans nan tout longè transkripsyon mRNA.Apwòch sa a fasilite yon eksplorasyon konplè nan splicing altènatif, fizyon jèn, poli-adenylation, ak quantification nan izoform mRNA.
Nanopore sekans depann sou nanopore sèl-molekil an tan reyèl siyal elektrik.Gide pa pwoteyin motè, ADN doub-cheche mare nan pwoteyin nanopore entegre nan yon biofilm, dewoulman pandan li pase nan kanal la nanopore anba yon diferans vòltaj.Siyal elektrik diferan ki te pwodwi pa baz diferan sou strand ADN yo detekte ak klase an tan reyèl, fasilite sekans nikleotid egzat ak kontinyèl.Apwòch inovatè sa a simonte limit lekti kout epi li bay yon platfòm dinamik pou analiz jenomik konplike, ki gen ladan etid transcriptomic konplèks.
Platfòm: Nanopore Promethion P48
-
Tout longè mRNA sekans -PacBio
Pandan ke sekans mRNA ki baze sou NGS se yon zouti versatile pou quantifier ekspresyon jèn, depandans li sou lekti kout limite itilizasyon li nan analiz transcriptomic konplèks.PacBio sekans (Iso-Seq), nan lòt men an, anplwaye teknoloji ki long li, ki pèmèt sekans nan tout longè transkripsyon mRNA.Apwòch sa a fasilite yon eksplorasyon konplè sou splicing altènatif, fizyon jèn ak poli-adenylation byenke li pa chwa prensipal pou quantification ekspresyon jèn, akòz gwo kantite done ki nesesè yo.
Teknoloji sekans PacBio depann sou sekans yon sèl molekil, an tan reyèl (SMRT), bay yon avantaj diferan nan kaptire transkripsyon mRNA tout longè.Apwòch inovatè sa a enplike itilizasyon zewo-mode waveguides (ZMWs), pwi mikwofabrike ki pèmèt obsèvasyon an tan reyèl nan aktivite ADN polymerase pandan sekans.Nan ZMW sa yo, ADN polymerase PacBio a fè sentèz yon seksyon konplemantè ADN, ki pwodui lekti long ki kouvri tout transkripsyon mRNA yo.Operasyon PacBio nan mòd sikilè sekans konsansis (CCS) amelyore presizyon nan repete sekans menm molekil la.Lekti HiFi yo pwodwi yo gen yon presizyon ki konparab ak NGS, plis kontribiye nan yon analiz konplè ak serye nan karakteristik transcriptomic konplèks.Platfòm: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sekans-Illumina
Sekans mRNA pèmèt pwofil konplè tout transkripsyon mRNA nan selil yo nan kondisyon espesifik.Teknoloji dènye kri sa a sèvi kòm yon zouti ki pisan, revele pwofil ekspresyon jèn konplike, estrikti jèn, ak mekanis molekilè ki asosye ak divès pwosesis byolojik.Lajman adopte nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, ak devlopman dwòg, sekans mRNA ofri apèsi sou konplisite nan dinamik selilè ak règleman jenetik.
Platfòm: Illumina NovaSeq X
-
Sekans mRNA ki pa baze sou referans-Illumina
Sekans mRNA pèmèt pwofil konplè tout transkripsyon mRNA nan selil yo nan kondisyon espesifik.Teknoloji dènye kri sa a sèvi kòm yon zouti ki pisan, revele pwofil ekspresyon jèn konplike, estrikti jèn, ak mekanis molekilè ki asosye ak divès pwosesis byolojik.Lajman adopte nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, ak devlopman dwòg, sekans mRNA ofri apèsi sou konplisite nan dinamik selilè ak règleman jenetik.
Platfòm: Illumina NovaSeq X
-
Long ki pa kodaj sekans-Illumina
Long ki pa kode RNAs (lncRNAs) se RNA ki pi long pase 200 nukleotid ki genyen yon minimòm potansyèl kodaj epi yo se eleman esansyèl nan RNA ki pa kode.Yo te jwenn nan nwayo a ak sitoplasm, RNA sa yo jwe yon wòl enpòtan nan règleman epigenetik, transkripsyon, ak pòs-transkripsyon, ki montre siyifikasyon yo nan fòme pwosesis selilè ak molekilè.Sekans LncRNA se yon zouti pwisan nan diferansyasyon selil, ontogenesis, ak maladi moun.
Platfòm: Illumina NovaSeq
-
Ti RNA sekans-Illumina
Ti molekil RNA (sRNA), anjeneral anba 200 nukleotid nan longè, gen ladan microRNAs (miRNAs), ti entèferans RNAs (siRNAs), ak piwi-interacting RNAs (piRNAs).Pami sa yo, miRNAs, anviwon 20-24 nukleotid longè, yo patikilyèman remakab pou wòl esansyèl regilasyon yo nan divès pwosesis selilè.Avèk modèl ekspresyon espesifik tisi ak etap espesifik, miRNA yo montre gwo konsèvasyon atravè diferan espès.
Platfòm: Illumina NovaSeq
-
circRNA sekans-Illumina
Sikilè RNA sekans (circRNA-seq) se pwofil ak analize RNAs sikilè, yon klas molekil RNA ki fòme bouk fèmen akòz evènman splicing ki pa canonical, bay RNA sa yo ak estabilite ogmante.Pandan ke yo te montre kèk circRNA yo aji kòm eponj microRNA, sekwe microRNAs ak anpeche yo reglemante mRNA sib yo, lòt circRNA yo ka kominike avèk pwoteyin, modile ekspresyon jèn, oswa gen wòl nan pwosesis selilè.Analiz ekspresyon circRNA bay enfòmasyon sou wòl regilasyon molekil sa yo ak siyifikasyon yo nan divès pwosesis selilè, etap devlopman, ak kondisyon maladi, kontribye nan yon konpreyansyon pi fon sou konpleksite règleman RNA nan yon kontèks ekspresyon jèn.
-
Sekans transcriptom antye - Illumina
Sekans transcriptom antye ofri yon apwòch konplè pou pwofil divès molekil RNA, ki anglobe tou de kodaj (mRNA) ak RNA ki pa kode (lncRNA, circRNA, ak miRNA).Teknik sa a kaptire transcriptom konplè selil espesifik nan yon moman, sa ki pèmèt yon konpreyansyon holistic nan pwosesis selilè yo.Epitou li te ye kòm "sekans RNA total," li gen pou objaktif pou revele rezo regilasyon konplike nan nivo transcriptom, ki pèmèt analiz apwofondi tankou konpetisyon RNA andojèn (ceRNA) ak analiz RNA jwenti.Sa a make premye etap la nan direksyon pou karakterizasyon fonksyonèl, patikilyèman nan debouche rezo regilasyon ki enplike entèraksyon ceRNA ki baze sou circRNA-miRNA-mRNA.
