-
Sekans metagenomik -NGS
Metagenome refere a yon koleksyon total de materyèl jenetik nan yon kominote melanje nan òganis, tankou metagenome anviwònman an, metagenome imen, elatriye.Sekans metagenomik se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki soti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman an.
Platfòm:Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans metagenomik-Nanopore
Metagenomics se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki sòti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman, elatriye. Nanopore sekans platfòm dènyèman te prezante. nan etid metagenomic.Pèfòmans eksepsyonèl li yo nan longè lekti lajman amelyore analiz metagenomik kouran an, espesyalman asanble metagenom.Pran avantaj de lekti-longè, etid metagenomic ki baze sou Nanopore se kapab reyalize plis asanble kontinyèl konpare ak metagenomics piki-zam.Li te pibliye ke metagenomics ki baze sou Nanopore te jenere avèk siksè jenom bakteri konplè ak fèmen nan mikrobyom (Moss, EL, et. al,Nati Biotech, 2020)
Platfòm:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Sou-inite sou 16S ak 18S rRNA ki genyen tou de rejyon trè konsève ak rejyon hyper-varyab se yon anprent molekilè pafè pou idantifikasyon òganis prokaryotic ak ekaryotik.Lè w ap pran avantaj de sekans, anplikon sa yo ka vize baze sou pati yo konsève ak rejyon hyper-varyab yo ka konplètman karakterize pou idantifikasyon mikwòb kontribye nan etid ki kouvri analiz divèsite mikwòb, taksonomi, filojeni, elatriye. Single-molecule an tan reyèl (SMRT). ) sekans nan platfòm PacBio pèmèt jwenn lekti long trè egzat, ki ta ka kouvri anplikon plen longè (apeprè 1.5 Kb).Vizyon an elaji nan jaden jenetik anpil amelyore rezolisyon an nan anotasyon espès nan kominote bakteri oswa fongis.
Platfòm:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Sekans anplikon 16S/18S/ITS vize revele filojeni, taksonomi, ak abondans espès nan yon kominote mikwòb lè yo mennen ankèt sou pwodwi PCR nan makè jenetik antretyen ki genyen tou de pati ki trè konvès ak ipèvaryab.Woeses et al, (1977) entwodiksyon anprent molekilè pafè sa yo pèmèt izolasyon mikrobyom pwofil.Sekans 16S (bakteri), 18S (chanpiyon) ak espas transkripsyon entèn (ITS, fongis) pèmèt idantifikasyon tou de espès abondan ak espès ki ra ak espès ki pa idantifye.Teknoloji sa a te vin tounen yon zouti lajman aplike ak pi gwo nan idantifye konpozisyon mikwòb diferans nan divès anviwònman, tankou bouch moun, trip, poupou, elatriye.
Platfòm:Platfòm Illumina NovaSeq
-
Bakteri ak chanpiyon Whole Genome Re-sekans
Re-sekans tout bakteri ak chanpiyon se yon zouti enpòtan pou konplete genòm bakteri ak fongis li te ye, epitou pou konpare plizyè jenom oswa kat jenom nouvo òganis yo.Li gen anpil enpòtans pou sekans tout genomic bakteri ak fongis yo nan lòd yo jenere jenom referans egzat, fè idantifikasyon mikwòb ak lòt etid genomic konparatif.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Sekans metatranskriptòm
Metatranscriptome sekans idantifye ekspresyon jèn mikwòb (tou de ekaryot ak prokaryot) nan anviwònman natirèl (sa vle di tè, dlo, lanmè, poupou, ak zantray.). Espesyalman, sèvis sa yo pèmèt ou jwenn pwofil ekspresyon jèn antye nan kominote mikwòb konplèks, analiz taksonomik espès yo, analiz fonksyonèl anrichisman jèn yo eksprime yon fason diferan, ak plis ankò.
Platfòm: Platfòm Illumina NovaSeq
-
Genomic chanpiyon
Teknoloji Biomarker bay sondaj genomic, genomic amann ak genomic pene-konplè nan chanpiyon depann sou objektif rechèch espesifik.Genome sekans, asanble ak anotasyon fonksyonèl ka reyalize lè w konbine pwochen jenerasyon sekans + Twazyèm jenerasyon sekans pou reyalize asanble genomic wo nivo.Teknoloji Hi-C kapab tou itilize pou fasilite asanble genòm nan nivo kwomozòm.
Platfòm:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Platfòm Illumina NovaSeq
-
Bakteri konplè genòm
Biomarker Technologies bay sèvis sekans sou konstriksyon konplè genomic bakteri ak diferans zewo.Flux travay prensipal nan konstriksyon jenom konplè bakteri gen ladan sekans twazyèm jenerasyon, asanble, anotasyon fonksyonèl ak analiz bioenfòmatik avanse ki satisfè objektif rechèch espesifik.Yon pwofil pi konplè nan jenom bakteri pèmèt revele mekanis fondamantal ki kache pwosesis byolojik yo, ki ta ka bay tou referans valab pou rechèch jenomik nan pi wo espès ekaryotik.
Platfòm:Nanopore PromethION P48 + Platfòm Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
