Plant/Animal Whole Genome Sekans

Tout genomic re-sekans, ke yo rele tou WGS, pèmèt revele nan tou de mitasyon komen ak ra sou genòm nan antye ki gen ladan Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Suppression Ensèsyon (InDel), Varyasyon Estrikti (SV), ak Varyasyon Nimewo Kopi (CNV). ).SV yo fòme yon pi gwo pòsyon nan baz varyasyon an pase SNP yo epi yo gen yon pi gwo enpak sou genòm nan, ki gen yon efè enpòtan sou òganis vivan yo.Resekans lekti long pèmèt pou idantifikasyon pi egzak nan fragman gwo ak varyasyon konplike paske lekti long fè li pi fasil travèse kwomozòm sou rejyon konplike tankou repete tandem, rejyon GC/AT ki rich, ak rejyon hyper-varyab.

Platfòm: Illumina, PacBio, Nanopore

Kontakte nou

Detay Sèvis

Demo Rezilta

Piblikasyon En

1.Service Avantaj

Anpil eksperyans nan sekans genòm pou plis pase 1000 espès.

Plis pase 800 ka pibliye ak yon faktè enpak akimilasyon plis pase 4000.

Analiz bioenfòmatik konplè sou apèl varyasyon ak analiz fonksyon.

2. Espesifikasyon Sèvis

Platfòm		Bibliyotèk	Pwofondè sek rekòmande
Illumina		PE 150	Pou SNP, InDel rele ≥ 10x Pou SV, CNY rele ≥ 30x
Nanopore		8 kb	Pou SV, CNY rele ≥ 20x
Pacbio	CCS	15 ko	Pou SNP, InDel, SV, CNY ki rele ≥ 10x

3. Egzijans echantiyon

Platfòm		Konk.(ng/μL)	Kantite lajan (ng)	Pite		Agarose jèl
				OD260/280	OD260/230	1. Klè gwoup prensipal ki pa gen okenn oswa limitedegradasyon yo obsève sou jèl. 2. Pa gen oswa limite RNA oswa kontaminasyon pwoteyin
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopore		≥30	Depann sou rannman done 10μg / selil	1.7-2.2	≥1.5
Pacbio	CCS	≥50		1.7-2.2	1.8-2.5

4. Bioinformation analiz

5. Koule Travay Sèvis

Livrezon echantiyon

Ekstraksyon ADN

Konstriksyon bibliyotèk

Sekans

Analiz done

Livrezon done

Previous: BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Pwochen: Sekans RNA yon sèl-nwayo

1) Estatistik nan kat jenom

Tablo 1 Estatistik rezilta kat

Figi 1 Distribisyon gwosè insert ak kouvèti lekti.

2) Deteksyon varye

Figi 2 Estatistik ak anotasyon SNP/INDEL/SV nan mitan echantiyon yo

Figi 3 Distribisyon nan jenom nan vatiations

3) Anotasyon fonksyonèl nan varyasyon

2019	Kominikasyon lanati	Resekans antye-genom revele orijin Brassica napus ak loci jenetik ki enplike nan amelyorasyon li yo
2020	PNAS	Orijin evolisyonè ak istwa domestik pwason wouj (Carassius auratus)
2021	Plant Biotechnologie Journal	Referans jenom de espès jut kiltive yo
2021	Plant Biotechnologie Journal	Siyati jenomik Brassicajuncea alopoliployid legim ak oleuze ak loci jenetik ki kontwole akimilasyon glikozinolat
2019	Plant molekilè	Resekans antye-genom nan yon koleksyon atravè lemond nan asansyon kolza revele baz jenetik nan divergence ekotip yo.
2022	Rechèch ortikilti	Analiz asosyasyon nan tout jenom bay yon apèsi molekilè sou varyasyon natirèl gwosè grenn melon an
2021	Jounal Botanik eksperimantal	Etid asosyasyon nan tout genòm idantifye varyant GhSAD1 ki bay tolerans frèt nan koton.
2021	Jounal Botanik eksperimantal	Etid asosyasyon nan tout genòm ak konparezon transcriptom revele nouvo QTL ak jèn kandida ki kontwole gwosè petal nan kolza.