-
Sekans metagenomik (NGS)
Metagenome refere a yon koleksyon total de materyèl jenetik nan yon kominote melanje nan òganis, tankou metagenome anviwònman an, metagenome imen, elatriye.Sekans metagenomik se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki sòti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman an.
Platfòm:Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sekans-Nanopore
Metagenomics se yon zouti molekilè ki itilize pou analize materyèl jenomik melanje ki sòti nan echantiyon anviwònman an, ki bay enfòmasyon detaye sou divèsite espès ak abondans, estrikti popilasyon, relasyon filojenetik, jèn fonksyonèl ak rezo korelasyon ak faktè anviwònman, elatriye. Nanopore sekans platfòm dènyèman te prezante. nan etid metagenomic.Pèfòmans eksepsyonèl li yo nan longè lekti lajman amelyore analiz metagenomik larivyè a, espesyalman asanble metagenom.Pran avantaj de lekti-longè, etid metagenomic ki baze sou Nanopore se kapab reyalize plis asanble kontinyèl konpare ak metagenomics piki-zam.Li te pibliye ke metagenomics ki baze sou Nanopore avèk siksè pwodwi jenom bakteri konplè ak fèmen soti nan mikrobyom (Moss, EL, et. al,Nati Biotech, 2020)
Platfòm:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Sou-inite sou 16S ak 18S rRNA ki genyen tou de rejyon trè konsève ak rejyon hyper-varyab se yon anprent molekilè pafè pou idantifikasyon òganis prokaryotik ak ekaryotik.Pran avantaj de sekans, anplikon sa yo ka vize baze sou pati yo konsève ak rejyon hyper-varyab yo ka konplètman karakterize pou idantifikasyon mikwòb kontribye nan etid ki kouvri analiz divèsite mikwòb, taksonomi, filojeni, elatriye. Single-molecule an tan reyèl (SMRT). ) sekans nan platfòm PacBio pèmèt jwenn nan lekti long trè egzat, ki ta ka kouvri tout longè anplikon (apeprè 1.5 Kb).Vizyon an elaji nan jaden jenetik anpil amelyore rezolisyon an nan espès anote nan kominote bakteri oswa fongis.
Platfòm:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Sekans anplikon 16S/18S/ITS vize revele filojeni, taksonomi, ak abondans espès nan yon kominote mikwòb lè yo mennen ankèt sou pwodwi PCR nan makè jenetik antretyen ki genyen tou de pati ki trè konvèse ak hypervariable.Woeses et al, (1977) entwodiksyon anprent molekilè pafè sa yo pèmèt izolasyon mikrobyom pwofil.Sekans 16S (bakteri), 18S (chanpiyon) ak espas transkripsyon entèn (ITS, fongis) pèmèt idantifikasyon tou de espès abondan ak espès ki ra ak espès ki pa idantifye.Teknoloji sa a te vin tounen yon zouti lajman aplike ak pi gwo nan idantifye konpozisyon mikwòb diferans nan divès anviwònman, tankou bouch moun, trip, poupou, elatriye.
Platfòm:Illumina NovaSeq6000
-
Bakteri ak chanpiyon Whole Genome Re-sekans
Re-sekans tout bakteri ak chanpiyon se yon zouti enpòtan pou konplete jenom bakteri ak fongis li te ye, ansanm ak konpare genòm plizyè oswa kat jenom nouvo òganis yo.Li gen anpil enpòtans pou sekans tout genomic bakteri ak fongis yo nan lòd yo jenere jenom referans egzat, fè idantifikasyon mikwòb ak lòt etid genomic konparatif.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
-
Genomic chanpiyon
Teknoloji Biomarker bay sondaj genomic, genomic amann ak genomic pene-konplè nan chanpiyon depann sou objektif rechèch espesifik.Genome sekans, asanble ak anotasyon fonksyonèl ka reyalize lè w konbine pwochen jenerasyon sekans + Twazyèm jenerasyon sekans pou reyalize asanble genomic wo nivo.Teknoloji Hi-C kapab tou itilize pou fasilite asanble genòm nan nivo kwomozòm.
Platfòm:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bakteri konplè genòm
Biomarker Technologies bay sèvis sekans sou konstwi genomic konplè bakteri ak diferans zewo.Flux travay prensipal nan konstriksyon jenom konplè bakteri gen ladan sekans twazyèm jenerasyon, asanble, anotasyon fonksyonèl ak analiz bioenfòmatik avanse ki satisfè objektif rechèch espesifik.Yon pwofil pi konplè nan jenom bakteri pèmèt revele mekanis fondamantal ki kache nan pwosesis byolojik yo, ki ta ka bay tou referans valab pou rechèch jenomik nan pi wo espès ekaryotik.
Platfòm:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
