-
Plant/Animal De novo Genome Sekans
De novosekans refere a konstriksyon tout genòm yon espès lè l sèvi avèk teknoloji sekans, pa egzanp PacBio, Nanopore, NGS, elatriye, nan absans yon genòm referans.Amelyorasyon remakab nan longè lekti nan teknoloji sekans twazyèm jenerasyon te pote nouvo opòtinite nan rasanble genòm konplèks, tankou sa yo ki gen gwo heterozygosity, gwo rapò nan rejyon repetitif, poliploid, elatriye. rezoud eleman repetitif, rejyon ki gen kontni GC nòmal ak lòt rejyon trè konplèks.
Platfòm: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
Asanble Genome ki baze sou Hi-C
Hi-C se yon metòd ki fèt pou kaptire konfigirasyon kwomozòm lè li konbine entèraksyon ki baze sou pwoksimite ak sekans segondè-debi.Yo kwè entansite nan entèraksyon sa yo dwe negatif korelasyon ak distans fizik sou kwomozòm.Se poutèt sa, done Hi-C ta ka gide gwoupman, lòd ak oryantasyon nan sekans reyini nan yon jenom bouyon ak ancrage sa yo sou sèten kantite kwomozòm.Teknoloji sa a pèmèt yon asanble genòm nan nivo kwomozòm nan absans kat jenetik ki baze sou popilasyon an.Chak genomic bezwen yon Hi-C.
Platfòm: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
Jenetik evolisyonè
Jenetik evolisyonè se yon sèvis sekans chaje ki fèt pou bay yon entèpretasyon konplè sou enfòmasyon evolisyonè materyèl yo bay ki baze sou varyasyon jenetik, ki gen ladan SNP, InDels, SVs ak CNV.Li bay tout analiz fondamantal ki nesesè pou dekri chanjman evolisyonè yo ak karakteristik jenetik popilasyon yo, tankou estrikti popilasyon, divèsite jenetik, relasyon filojenik, elatriye. Li genyen tou etid sou koule jèn, ki pèmèt estimasyon gwosè popilasyon efikas, tan divergence.
-
Jenomik konparatif
Genomik konparatif literalman vle di konpare sekans genomic konplè ak estrikti diferan espès yo.Disiplin sa a gen pou objaktif pou revele evolisyon espès yo, fonksyon jèn yo, mekanis regilasyon jèn yo nan nivo genòm nan idantifye estrikti sekans yo ak eleman ki konsève oswa diferansye atravè diferan espès yo.Etid genomik konparatif tipik gen ladan analiz nan fanmi jèn, devlopman evolisyonè, duplication antye genomic, presyon selektif, elatriye.
-
Bulked analiz Segregant
Bulked segregant analysis (BSA) se yon teknik ki itilize pou byen vit idantifye fenotip ki asosye makè jenetik yo.Flux travay prensipal nan BSA gen chwazi de gwoup moun ki gen fenotip trè opoze, mete ADN nan tout moun yo fòme de gwo ADN, idantifye sekans diferans ant de pisin.Teknik sa a te itilize anpil nan idantifye makè jenetik fòtman ki asosye pa jèn vize nan jenom plant / bèt.
