● Ka Pwojè Abondan: depi kreyasyon li an 2009, BMKGENE te konplete dè santèn de pwojè espès nan rechèch GWAS popilasyon an, ede chèchè yo pibliye plis pase 100 atik, ak faktè enpak kimilatif la te rive nan 500.
● Analis pwofesyonèl.
● Kout analiz sik.
● Min done egzat.
Kalite | Echèl Popilasyon | Estrateji sekans ak pwofondè |
SLAF-GWAS | Nimewo echantiyon ≥200 | Gwosè genòm <400M, ak ref-genom, WGS rekòmande |
Gwosè genòm ≤ 1G, 100K Tags ak 10X | ||
1G ≤ gwosè jenom ≤ 2G, 200K Tags ak 10X | ||
Gwosè genòm > 2G, 300K Tags ak 10X | ||
WGS-GWAS | Nimewo echantiyon ≥200 | 10X pou chak echantiyon |
Diferan varyete, sou-espès, ras/genebanks/fanmi melanje/resous sovaj
Diferan varyete, subespès, ras
Fanmi mwatye frè / fanmi konplè / resous sovaj
● Analiz asosyasyon nan tout genòm
● Analiz ak tès depistaj SNP enpòtan
● Anotasyon fonksyonèl nan jèn kandida
a.Fenotip QC
Istogram distribisyon frekans
Estatistik fenotip
b.Analiz asosyasyon (Modèl: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)
QQ Trase
Konplo Manhattan
Ane | Jounal | IF | Tit |
2022 | NC | 17.69 | Baz jenomik giga-kwomozòm yo ak giga-genom pivwan pye bwa Paeonia ostii |
2015 | NP | 7.43 | Anprent domestikasyon anre rejyon jenomik ki gen enpòtans agronomi nan plant soya |
2018 | MP | 9.32 | Resekans antye-genom nan yon koleksyon atravè lemond nan asansyon kolza revele baz jenetik nan divergence ekotip yo. |
2022 | HR | 7.29 | Analiz asosyasyon nan tout jenom bay yon apèsi molekilè sou varyasyon natirèl gwosè grenn melon an |