Platfòm | Gwosè Bibliyotèk | Done teyorik pwodiksyon (pa selil) | Yon sèl-baz Presizyon | Aplikasyon |
Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Selil | 85-92% | Rele SV, De novo, Sekans tout longè, Iso-Seq, Anotasyon Gene, Deteksyon metilation ADN |
● Plis pase 5 ane eksperyans sou platfòm sekans PacBio ak plizyè milye pwojè fèmen ak divès espès.
● BMKGENE se yon patnè ofisyèl nan Oxford Nanopore, ak sètifikasyon doub platfòm RNA/DNA.
● Gen modèl endikap nan sekansè ak ekipman konplè ak ase debi sekans.
● Ki baze sou platfòm Nanopore, plis pase 10 rechèch sou bèt ak plant Denovo yo te pibliye nan jounal ki renome entènasyonalman.
Kalite echantiyon | Kantite lajan | Konsantrasyon (Qubit ®) | Volim | Pite | Lòt moun |
ADN jenomik | Depann sou Done Egzijans | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5; Klè pik nan 260 nm, pa gen okenn kontaminasyon | Konsantrasyon bezwen mezire pa Qubit ak Qubit/Nanopore ≤ 2 |
RNA total | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5;pa gen kontaminasyon | Valè RIN ≥7.5 |
Evalyasyon Kalite Done echantiyon ADN
Tablo 1. Estatistik sou done pwòp.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | cleanSumBase | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | cleanMaxLen | cleanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Evalyasyon Kalite Done echantiyon RNA
Tablo 1. Estatistik sou done pwòp.
Non dosye | ID Kliyan | ReadNum | BaseNum | N50 | MeanLength | MaxLength | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
Figi 1. Li distribisyon longè
Figi 2. Distribisyon nòt kalite done pwòp
Figi 3. Longè ak bon jan kalite distribisyon nòt done pwòp