1) Rezolisyon sub-selilè: Chak zòn kaptire genyen > 2 milyon Tach Barcoded espasyal ak yon dyamèt 2.5 µm ak yon espas 5 µm ant sant tach yo, ki pèmèt analiz transcriptom espasyal ak rezolisyon sub-selilè (5 µm).
2) analiz rezolisyon milti-nivo: analiz fleksib milti-nivo sòti nan 100 μm a 5 μm pou rezoud divès kalite tisi nan rezolisyon optimal.
3) Profile transcriptom konplè: transkripsyon yo te kaptire nan glise tisi a tout antye ka analize, san restriksyon sou kantite jèn sib ak zòn sib.
Bibliyotèk | Estrateji sekans | Done Sòti rekòmande |
Bibliyotèk cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/echantiyon |
Egzanp | Nimewo | Gwosè | Kalite RNA |
OCT entegre blòk tisi | 2-3 blòk / echantiyon | Apeprè.6.8x6.8x6.8 mm3 | RIN≥7 |
Pou plis detay sou gid preparasyon echantiyon ak workflow sèvis, tanpri ou lib pou pale ak yonEkspè BMKGENE
Done ki te pwodwi pa BMKMANU S1000 analize lè l sèvi avèk lojisyèl "BSTMatrix", ki fèt poukont pa BMKGENE, ki gen ladan:
1) Jenerasyon matris ekspresyon jèn
2) HE pwosesis imaj
3) konpatib ak lojisyèl en twazyèm pati pou analiz
4) Sou entènèt "BSTViewer" ede jwenn rezilta vizyalizasyon nan diferan rezolisyon.
1.Spot clustering
2.Distribisyon espasyal
Note: Rezolisyonnivo = 13 (100 µm, gòch); 7 (50 µm, dwat)
3.Marker ekspresyon abondans clustering heatmap
4.Entè-echantiyon done analiz