Ladica toplinske karte koristi se za crtanje toplinske karte, koja može filtrirati, normalizirati i grupirati podatke matrice. Uglavnom se koristi za klaster analizu razine ekspresije gena između različitih uzoraka.
Pripajanje bioloških funkcija sekvencama u FASTA datoteci usklađivanjem sekvenci s bazom podataka, uključujući NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) je algoritam i program za pronalaženje regija sa sličnim biološkim sekvencama.Uspoređuje ove sekvence s bazama podataka o sekvencama i izračunava statističku značajnost.BLAST se sastoji od četiri vrste alata na temelju vrste sekvence: blastn, lastp, blastx i tblastn.