Dok sekvenciranje mRNA temeljeno na NGS-u služi kao svestran alat za kvantifikaciju ekspresije gena, njegovo oslanjanje na kratka čitanja ograničava njegovu učinkovitost u složenim transkriptomskim analizama.PacBio sekvenciranje (Iso-Seq), s druge strane, koristi tehnologiju dugog čitanja, omogućujući sekvenciranje mRNA transkripata pune duljine.Ovaj pristup olakšava sveobuhvatno istraživanje alternativnog spajanja, spajanja gena i poliadenilacije iako nije primarni izbor za kvantifikaciju ekspresije gena.Kombinacija 2+3 premošćuje jaz između Illumina i PacBio oslanjajući se na očitavanja PacBio HiFi za identificiranje kompletnog skupa izoformi transkripta i NGS sekvenciranje za kvantifikaciju istih izoformi.
Platforme: PacBio Sequel II i Illumina NovaSeq