MIKROBNI
Bakterijska kompatibilnost i imobilizacija biougljenim poboljšala je razgradnju tebukonazola, sastav i funkcioniranje mikrobioma tla
Sekvenciranje 16S amplikona pune dužine |PacBio HiFi |Alfa raznolikost |Beta raznolikost
U ovoj studiji, sekvenciranje 16S amplikona pune duljine pomoću PacBio i bioinformatičku analizu osigurao je Biomarker Technologies.
Naglasci
Biougljenim imobiliziranim bakterijama koje razgrađuju tebukonazol Alcaligenes faecalis WZ-2 proučavana je učinkovitost biorazgradnje i učinak na tlo onečišćeno tebukonazolom u usporedbi sa sojem WZ-2 koji se slobodno razgrađuje.
1. WZ-2 imobiliziran biougljenim pokazao je učinkovitiju razgradnju tebukonazola u usporedbi sa slobodnim WZ-2 smanjenjem poluživota tebukonazola u tlu s 18,7 dana na 13,3 dana.
2. Biougljeni imobilizirani WZ-2 bili su u mogućnosti obnoviti prirodne aktivnosti enzima mikroba u tlu, uključujući ureazu, dehidrogenazu i invertazu, itd.
3. Mikrobni profil u tlu tretiranom biougljenim WZ-2 određen 16S sekvenciranjem pune dužine snažno podupire da ovaj sustav može obnoviti zdravlje tla poboljšanjem strukture bakterijske zajednice pod kontaminacijom tebukonazolom.
Eksperiment (u vezi sa sekvenciranjem)
Grupiranje: CK: Prirodno tlo;T: Tlo pomiješano s tebukonazolom;S: tlo koje je sadržavalo tebukonazol sa slobodnim sojem WZ-2;BC: Tebukonazol je sadržavao tlo s biougljenim;BCS: tlo koje je sadržavalo tebukonazol s imobiliziranim biougljem WZ-2.
Uzorkovanje: Ukupna ekstrakcija DNK tla pojačana 16S rDNA početnicama
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) i 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),predstavlja 16S rDNA pune dužine
Platforma za sekvenciranje: PacBio RS II
Strategija sekvenciranja: CCS HIFI čita
Analiza podataka:BMKCloudBioinformatička platforma čini zlatnu ribicu izvrsnim sustavom genetskog modela za fiziologiju i evoluciju riba.
Proizlaziti
Struktura mikrobne zajednice tla određena je sekvenciranjem 16S rDNA.OTU bogatstvo i indeks alfa raznolikosti, uključujući Chao1, Ace, Shannon i Simpson indekse procijenjeni su kako bi se otkrila raznolikost vrsta u svakom sustavu.Nakon 60 dana inkubacije, svi su indeksi pokazali sličan trend, tj. tebukonazol je mogao izazvati smanjenje bogatstva vrsta i raznolikosti u tlu.Međutim, dodavanjem soja WZ-2, zajednica bakterija u tlu je djelomično obnovljena u smislu bogatstva i raznolikosti.Uočena je ograničena razlika između BC, BCS i CK, što ukazuje da biougljen i biougljen imobilizirani WZ-2 mogu učinkovito obnoviti biološko zdravlje tla.
Neponderirana metoda parova s aritmetičkim sredinama (UPGMA) primijenjena je u ovoj studiji kako bi se pokazala beta raznolikost među skupinama.Kao što je prikazano na sljedećoj slici, BC, BSC i CK dijelili su sličniji obrazac mikrobnog sastava u usporedbi sa skupinom T i S, što je dodatno pokazalo da bi uvođenje biougljena u bioremedijaciju tla onečišćenog tebukonazolom moglo uvelike olakšati oporavak mikrobne zajednice u tlu.
Lik.UPGMA grupiranje bakterijske zajednice na razini vrste pod različitim tretmanom
Referenca
Sun, Tong i sur.“Bakterijska kompatibilnost i imobilizacija biougljenim poboljšali su razgradnju tebukonazola, sastav i funkcioniranje mikrobioma tla.”Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.
Vijesti i istaknuto ima za cilj podijeliti najnovije uspješne slučajeve s Biomarker Technologies, bilježeći nova znanstvena dostignuća kao i istaknute tehnike primijenjene tijekom studije.
Vrijeme objave: 8. siječnja 2022