-
Proteomika
Proteomika uključuje primjenu tehnologija za kvantifikaciju ukupnog prisutnog sadržaja proteina u stanici, tkivu ili organizmu.Tehnologije temeljene na proteomici koriste se u različitim kapacitetima za različite istraživačke postavke kao što su detekcija različitih dijagnostičkih markera, kandidata za proizvodnju cjepiva, razumijevanje mehanizama patogenosti, promjena obrazaca ekspresije kao odgovor na različite signale i tumačenje funkcionalnih proteinskih putova u različitim bolestima.Trenutno se kvantitativne proteomske tehnologije uglavnom dijele na kvantitativne strategije TMT, Label Free i DIA.
-
Metabolomika
Metabolom je krajnji nizvodni produkt genoma i sastoji se od ukupnog komplementa svih molekula niske molekularne težine (metabolita) u stanici, tkivu ili organizmu.Metabolomika ima za cilj mjerenje širokog spektra malih molekula u kontekstu fizioloških podražaja ili bolesnih stanja.Metodologije metabolomike spadaju u dvije različite skupine: neciljana metabolomika, namjeravana sveobuhvatna analiza svih mjerljivih analita u uzorku uključujući kemijske nepoznanice korištenjem GC-MS/LC-MS, i ciljana metabolomika, mjerenje definiranih skupina kemijski karakteriziranih i biokemijski označeni metaboliti.
-
Skupna analiza segregacije
Bulked segregant analiza (BSA) je tehnika koja se koristi za brzo identificiranje genetskih markera povezanih s fenotipom.Glavni tijek rada BSA uključuje odabir dviju skupina pojedinaca s izrazito suprotnim fenotipovima, udruživanje DNK svih pojedinaca kako bi se formirala dva skupa DNK, identificiranje diferencijalnih sekvenci između dva skupa.Ova tehnika je intenzivno korištena u identificiranju genetskih markera snažno povezanih s ciljanim genima u biljnim/životinjskim genomima.
-
Sekvenciranje DNA/RNA – Nanopore sekvencer
ONT sekvenciranje je tehnologija sekvenciranja električnog signala jedne molekule u stvarnom vremenu temeljena na nanoporama, princip sekvenciranja svake platforme je isti.Dvolančana DNA/RNA vezat će se za nanoporozni protein ugrađen u biofilm i odmotavajući se pod vodstvom motornog proteina, pod djelovanjem razlike napona s obje strane biofilma, DNA/RNA lanci prolaze kroz proteinski kanal nanopora na određenoj točki stopa.Zbog razlika u kemijskim svojstvima različitih baza na lancu DNA/RNA, kada jedna baza ili molekula DNA prođe kroz kanal nanopora, to će izazvati promjenu različitih električnih signala.Detektiranjem i usklađivanjem s tim signalima mogu se izračunati odgovarajući osnovni tipovi i može se dovršiti detekcija sekvence u stvarnom vremenu.
-
Sekvenciranje DNA/RNA -PacBio Sequencer
PacBio platforma za sekvenciranje dugo je čitana platforma za sekvenciranje, koja je također poznata kao jedna od tehnologija sekvenciranja treće generacije (TGS).Temeljna tehnologija, single-molecule real-time (SMRT), omogućuje generiranje čitanja s duljinom od desetak kilo-baza.Na temelju "sekvenciranja po sintezi", razlučivost jednog nukleotida postiže se nultim valovodom (ZMW), gdje je samo ograničeni volumen na dnu (mjesto sinteze molekule) osvijetljen.Osim toga, SMRT sekvenciranje u velikoj mjeri izbjegava pristranost specifičnu za sekvencu u NGS sustavu, jer većina koraka PCR pojačanja nije potrebna u procesu izgradnje knjižnice.
Platforma: Nastavak II, Revio
