Analiza eukariotske mRNA (s referencom)
Na temelju poznatog slijeda genoma i informacija o napomenama, nova generacija podataka sekvenciranja visoke propusnosti (RNA-Seq) koristi se kao ulaz, a identificiraju se nova mjesta transkripcije (novi gen) i novi varijabilni događaji spajanja.procjena kvalitete podataka sekvenciranja;sekvenciranje podataka i usklađivanje sekvenci odabranog referentnog genoma, identificiranje granica egzona/introna, analiza spajanja genske varijante, istraživanje genskih regija i novih transkripata, identificiranje SNP mjesta transkribirane regije, granica između 3' i 5 ' gena, te funkcionalna anotacija i analiza obogaćivanja različitih uzoraka (skupina).
Duge nekodirajuće RNA
Duge nekodirajuće RNA (lncRNA) vrsta su transkripata duljine veće od 200 nt, koji ne mogu kodirati proteine.Akumulirani dokazi sugeriraju da je većina lncRNA vrlo vjerojatno funkcionalna.Tehnologije sekvenciranja visoke propusnosti i alati za bioinformatičku analizu omogućuju nam učinkovitije otkrivanje sekvenci lncRNA i informacija o pozicioniranju te nas vode do otkrivanja lncRNA s ključnim regulatornim funkcijama.BMKCloud s ponosom pruža našim klijentima platformu za analizu sekvenciranja lncRNA za postizanje brze, pouzdane i fleksibilne analize lncRNA.
16S/18S/ITS sekvenciranje amplikona
Platforma za analizu mikrobne raznolikosti razvijena je s dugogodišnjim iskustvom u projektnoj analizi mikrobne raznolikosti, koja sadrži standardiziranu osnovnu analizu i personaliziranu analizu: osnovna analiza pokriva sadržaj glavne analize trenutnih istraživanja mikroba, sadržaj analize je bogat i sveobuhvatan, a rezultati analize su prikazani u obliku projektnih izvješća;Sadržaj personalizirane analize je raznolik.Uzorci se mogu odabrati i parametri se mogu fleksibilno postaviti prema izvješću o osnovnoj analizi i svrsi istraživanja, kako bi se ostvarili personalizirani zahtjevi.Operativni sustav Windows, jednostavan i brz.
Metagenomika sačmarice (NGS)
Metagenomski podaci koriste se za analizu mješovitih genomskih materijala ekstrahiranih iz uzoraka okoliša, koji pružaju detaljne informacije o raznolikosti vrsta i brojnosti, strukturi populacije, filogenetskom odnosu, funkcionalnim genima i korelacijskoj mreži s čimbenicima okoliša.
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Cjevovod integrirane analize razvijen je za istraživače bez prethodnog znanja o bioinformatici i radi na poslužitelju visokih performansi.Olakšava brzo izvršavanje zadataka kao što su kontrola kvalitete podataka, usklađivanje sekvenci, otkrivanje varijacija SNP/InDel/SV, označavanje i mutacija gena.
GWAS
Korištenjem specifičnih statističkih metodologija, GWAS analiza ima za cilj otkriti varijacije nukleotida na cijelom genomu u korelaciji s fenotipskim razlikama.Ima ključnu ulogu u istraživanju funkcionalnih gena povezanih sa složenim ljudskim bolestima i zamršenim svojstvima biljaka i životinja.
BSA
Integrirana platforma za analizu pruža korisničko sučelje za standardiziranu i personaliziranu analizu raznolikosti.BSA analiza uključuje spajanje jedinki s ekstremnim fenotipskim osobinama iz segregacijske populacije.Uspoređujući diferencijalne lokuse između objedinjenih uzoraka, ovaj pristup brzo identificira usko povezane molekularne markere povezane s ciljnim genima.Naširoko se koristi u genetskom mapiranju biljaka i životinja, vrijedan je alat za oplemenjivanje uz pomoć markera i pozicioniranje gena.
Evolucijska genetika
To je integrirani radni tijek analize dizajniran za istraživače s ograničenom bioinformatičkom stručnošću.Iskorištavajući veliko iskustvo BMKGENE-a u projektima genetske evolucije, ova platforma radi na poslužiteljima visokih performansi, osiguravajući brzo i precizno izvršenje personaliziranih analiza.Oni obuhvaćaju zadatke poput izgradnje filogenetskog stabla, analize neravnoteže povezivanja, procjene genetske raznolikosti, identifikacije selektivnog pregleda, analize srodstva, analize glavnih komponenti i karakterizacije strukture populacije.
