BMKGENE je pružio usluge sekvenciranja prostornog transkriptoma za studiju “STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transscriptomic data”, koja je objavljena u Briefings in Bioinformatics.
Ovo je istraživanje predložilo nenadzirani i višestruki algoritam temeljen na učenju, Spatial Transcriptome Clustering Type (STEEL), koji identificira domene iz prostornog transkriptoma klasteriranjem kuglica koje pokazuju vrlo slične profile ekspresije gena i malu prostornu udaljenost na način grafova.
Sveobuhvatna procjena STEEL-a na prostornim transkriptomskim skupovima podataka s platforme 10X Visium pokazuje da ne samo da postiže visoku rezoluciju za karakterizaciju finih struktura mišjeg mozga, već također omogućuje integraciju više slajdova tkiva pojedinačno analiziranih u jedan veći.
S napretkom tehnologija prostornih transkriptoma, naša će metoda imati veliku primjenjivost u identifikaciji domene i rekonstrukciji atlasa ekspresije gena.
Klikovdjekako biste saznali više o ovoj studiji.
Vrijeme objave: 20. listopada 2023