Jedna važna hortikulturna karakteristika koja razlikuje pupčane naranče od ostalih uobičajenih sorti slatkih naranči je prisutnost pupka na plodu.Ova značajka također je važan kriterij za klasifikaciju hortikulturnih sorti slatke naranče.
Klijenti BMKGENE-a koristili su BMKGENE-ovu SLAF tehnologiju sekvenciranja koju je samostalno razvio kako bi proveli studiju pod nazivom “Geni rudarenja povezani s kvalitetom ploda slatkih naranči na temelju specifičnog sekvenciranja fragmenata pojačanog lokusa.“
Studija je uključivala sekvenciranje 240 resursa germplazme slatke naranče s velikom genetskom raznolikošću i različitim geografskim podrijetlom, što je rezultiralo s 497,82 Mb kratkočitanih podataka.Analizom podataka dobiveno je 1.467.968 SNP genotipova u cijelom genomu.Korištenjem Fst analize, studija je identificirala 6 gena kandidata povezanih s prisutnošću pupka, težinom ploda i titrirajućom kiselošću, pružajući osnovu za ciljano poboljšanje sorti slatke naranče.
Za sekvenciranje velike populacije, sekvenciranje pojačanih fragmenata specifičnog lokusa (SLAF) isplativije je i učinkovitije u usporedbi s sekvenciranjem cijelog genoma (WGS).
Klikovdjekako biste saznali više o ovoj studiji.
Vrijeme objave: 5. prosinca 2023