BMKCloud Log in
条形banner-03

Proizvodi

Sekvenciranje eukariotske mRNA-Illumina

Sekvenciranje mRNA omogućuje profiliranje svih mRNA transkripiranih iz stanica pod određenim uvjetima.To je moćna tehnologija za otkrivanje profila ekspresije gena, strukture gena i molekularnih mehanizama određenih bioloških procesa.Do danas je sekvencioniranje mRNA naširoko korišteno u temeljnim istraživanjima, kliničkoj dijagnostici, razvoju lijekova itd.

Platforma: Illumina NovaSeq platforma


Pojedinosti usluge

Bioinformatika

Demo rezultati

Prednosti

● Visoko iskusan: Više od 200 000 uzoraka obrađeno je u BMK-u pokrivajući različite tipove uzoraka, uključujući stanične kulture, tkiva, tjelesne tekućine itd. i više od 7 000 mRNA-Seq projekata je zatvoreno pokrivajući različita područja istraživanja.

● Strogi sustav kontrole kvalitete: ključne točke kontrole kvalitete kroz sve korake, uključujući pripremu uzorka, pripremu biblioteke, sekvenciranje i bioinformatiku, pod pomnim su nadzorom kako bi se dobili rezultati visoke kvalitete.

● Dostupne su više baza podataka za označavanje funkcija i studije obogaćivanja za ispunjavanje različitih istraživačkih ciljeva.

● Usluge nakon prodaje: Usluge nakon prodaje vrijede 3 mjeseca nakon završetka projekta, uključujući praćenje projekta, rješavanje problema, pitanja i odgovore o rezultatima itd.

Zahtjevi za uzorke i isporuka

Knjižnica Strategija sekvenciranja Preporučeni podaci Kontrola kvalitete
Poli A obogaćen Ilumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Zahtjevi za uzorke:

nukleotidi:

Konc. (ng/μl)

Količina (μg)

Čistoća

Integritet

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Na gelu se vidi ograničena ili nikakva kontaminacija proteinima ili DNK.

Za biljke: RIN≥6,5;

Za životinje: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

ograničena ili nikakva osnovna elevacija

Maramica: Težina (suha):≥1 g
*Za tkivo manje od 5 mg, preporučujemo slanje brzo zamrznutog (u tekućem dušiku) uzorka tkiva.

Suspenzija stanica:Broj stanica = 3×106- 1×107
*Preporučamo slanje zamrznutog lizata stanica.U slučaju da ta ćelija broji manje od 5×105.

Uzorci krvi:Volumen≥1 ml

Mikroorganizam:Masa ≥ 1 g

Preporučena dostava uzoraka

Spremnik: epruveta za centrifugu od 2 ml (ne preporučuje se limena folija)

Označavanje uzorka: Grupa + ponavljanje npr. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Pošiljka:

  1. Suhi led: Uzorke je potrebno pakirati u vreće i zakopati u suhi led.
  2. RNAstable epruvete: RNA uzorci se mogu osušiti u RNA stabilizacijskoj epruveti (npr. RNAstable®) i otpremiti na sobnoj temperaturi.

Tijek rada usluge

Uzorak QC

Dizajn eksperimenta

dostava uzorka

Dostava uzoraka

Pilot eksperiment

ekstrakcija RNA

Priprema knjižnice

Izgradnja knjižnice

Sekvenciranje

Sekvenciranje

Analiza podataka

Analiza podataka

Usluge nakon prodaje

Usluge nakon prodaje


  • Prethodna:
  • Sljedeći:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukariotski Tijek rada analize sekvenciranja mRNA

    Bioinformatika

    ØKontrola kvalitete sirovih podataka

    ØUsklađivanje referentnog genoma

    ØAnaliza strukture transkripta

    ØKvantifikacija ekspresije

    ØAnaliza diferencijalnog izraza

    ØFunkcijska anotacija i obogaćivanje

    1.Krivulja zasićenja podataka mRNA

    3(1)

    2.Diferencijalna analiza izraza - grafikon vulkana

    4(1)

    3.KEGG napomena na DEG-ovima

    5(1)

    4.GO klasifikacija na DEG

    6(1)

    dobiti citat

    Ovdje napišite svoju poruku i pošaljite nam je

    Pošaljite nam svoju poruku: